对于任何细胞分泌机制，需要了解的关键问题集中在确保在不破坏膜屏障的情况下实现分泌的过程、该过程如何被激发以及如何选择底物。我们正在对两种截然不同的细菌分泌系统进行结构研究，这两种系统采取了几乎相反的方法，但其中的结构正开始深入研究其机制。最近的工作将展示与Twin精氨酸转运（或Tat）系统的对比，这是一个相对简单的2或3组分系统，它能够运输各种大小、形状和电荷都非常不同的全折叠蛋白质底物，而不会促进与第三型分泌系统（或T3SS）的细胞泄漏由超过15种蛋白质构成的蛋白质纳米机器，可将完全展开的底物直接分泌到病原体的宿主细胞中。通过对这两种系统的比较，再次证明了如何使用非常不同的机制和架构来实现更相似的生物效果。这些系统的结构研究所面临的困难也将得到强调，混合结构方法的使用也将扩大我们的理解。
