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延迟矩阵统计

应用于“DelayedMatrix”对象的行和列的函数


生物导体版本:释放(3.19)

“matrixStats”API的端口,用于“DelayedArray”包中的DelayedMatrix对象。对DelayedMatrix对象的行和列进行操作的高性能函数,例如col/rowMedians()、col/lowRanks()和col/rowSds()。针对每种数据类型和子集合计算优化的函数,以使内存使用和处理时间最小化。

作者:彼得·希基、埃尔维·帕吉斯(HervéPagès)[ctb]、亚伦·伦(Aaron Lun)[ctb]

维护人员:彼得·希基(Peter Hickey)<gmail.com>

引文(从R中输入引文(“DelayedMatrixStats”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“DelayedMatrixStats”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“延迟矩阵统计”)
DelayedMatrixStats概述 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 数据表示,基础设施,软件
版本 1.26.0
在生物导体中 生物技术3.6(R-3.4)(6.5年)
许可证 MIT+文件许可证
取决于 矩阵泛型(>= 1.15.1),延迟阵列(>= 0.27.10)
进口 方法,稀疏矩阵统计(>= 1.13.2),矩阵(>= 1.5-0),S4载体(>= 0.17.5),I范围(>= 2.25.10)
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/PeteHaitch/DelayedMatrixStats网站
错误报告 https://github.com/PeterHaitch/DelayedMatrixStats/问题
查看更多
建议 测试那个,针织物,rmarkdown公司,仿生风格,微基准,专业人员,HDF5阵列,矩阵统计(>= 1.0.0)
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取决于我
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 延迟矩阵统计_1.26.0.tar.gz
Windows二进制 延迟MatrixStats_1.26.0.zip
macOS二进制(x86_64) 延迟矩阵统计_1.26.0.tgz
macOS二进制(arm64) 延迟矩阵统计_1.26.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DelayedMatrixStats网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/DelayedMatrixStats
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/DelayedMatrixStats网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/DelayedMatrixStats网站/
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