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细胞索引

单元格类型的参考索引


生物导体版本:释放(3.18)

提供一组带有筛选细胞类型标签的参考表达数据集,用于单细胞数据的自动注释或批量RNA-seq的反褶积等程序。

作者:德维·阿兰[aut],亚伦·伦[aut,cre,cph],丹尼尔·布尼斯[aut],杰瑞德·安德鲁斯[aut]Friederike Dündar[aut'

维护人员:亚伦·伦(Aaron Lun)<infine.monkeys.with.keyboards at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“celldex”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“celldex”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“celldex”)
单元格类型引用 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式

细节

生物视图 实验数据,实验中心,表达式数据,RNASeq数据,排序数据
版本 1.12.0
许可证 GPL-3公司
取决于 摘要实验
进口 实用程序,实验中心,批注中心,注释Dbi,S4载体,DelayedArray(延迟阵列),延迟矩阵统计
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/LTLA/celldex
错误报告 https://support.bioconductor.org网站/
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建议我 本体程序,单个R,tidy单细胞实验
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 单元格索引_1.12.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/celldex网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/单元索引
包短Url https://bioconductor.org/packages/celldex网站/
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