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BiocSingular公司

生物导体封装的奇异值分解


生物导体版本:释放(3.19)

在一个框架中实现奇异值分解和主成分分析的精确和近似方法,使它们能够在Bioconductor包或工作流程中轻松切换。在可能的情况下,使用BiocParallel框架实现并行化。

作者:亚伦·伦[aut,cre,cph]

维护人员:亚伦·伦(Aaron Lun)<infine.monkeys.with.keyboards at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“BiocSingular”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“BiocSingular”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“BiocSingular”)
1.SVD和PCA HTML格式 R脚本
2.矩阵类 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 尺寸缩减,主要组件,软件
版本 1.20.0
在生物导体中 生物技术3.9(R-3.6)(5年)
许可证 GPL-3型
取决于
进口 生物遗传学,S4载体,矩阵、方法、实用程序,延迟阵列,生物并行,缩放矩阵,厄尔巴,rsvd公司,卢比,海滩上的人
系统要求 C++17
统一资源定位地址 https://github.com/LTLA/BiocSingular网站
错误报告 https://github.com/LTLA/BiocSingular/issues网站
查看更多
建议 测试那个,仿生风格,针织物,rmarkdown公司,残差矩阵
链接到 卢比,海滩上的人
增强功能
取决于我 OSCA高级、OSCA基本、OSCA多采样、OSCA工作流
导入我 贝叶斯空间,科坦,延迟张量,恐龙,GSVA公司,纳米MethViz,NewWave公司,PCA工具,SCArray.sat公司,SCArray公司,单个R,批处理器,集群实验,百万卢比,蒙莫萨,scDblFinder,sc合并,散射,尖叫声,卵石,速度捕捉器
建议我 残差矩阵,缩放矩阵,旅行者号,雪花石膏矩阵,奇哈亚,空间热图,飞溅,HCA数据
指向我的链接
生成报告 生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 生物单体_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 BiocSingular_1.20.0.zip公司
macOS二进制(x86_64) 生物信号_1.20.0.tgz
macOS二进制(arm64) 生物信号_1.20.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BiocSignal公司
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:软件包/BiocSingular
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/BiocSingular网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/BiocSingular公司/
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