×

Omics管道

swMATH ID: 26801
软件作者: Fisch KM、Meissner T、Gioia L、Ducom JC、Carland TM、Loguercio S等人。
描述: Omics管道(http://sulab.scripps.edu/omicspipe)是一个计算框架,可在高性能计算集群和云中自动执行多经济数据分析管道。它支持RNA-seq、miRNA-seque、Exome-seq、全基因组测序、ChIP-seq分析和癌症基因组图谱(TCGA)数据自动处理的最佳实践发布管道。Omics Pipe为研究人员提供了一种可重复、开源和可扩展的下一代测序分析工具。Omics Pipe的目标是通过显著提高最佳实践计算管道的可访问性和再现性,使下一代测序分析民主化,这将使研究人员能够产生具有生物学意义和可解释的结果。
主页: http://sulab.scripps.edu/omicspipe/
相关软件: 水蟒;IPython公司;PyPI公司;生物红宝石;生物SQL;生物爪哇;拉夫斯;KNIME公司;塔维纳;生物物理;树皮;科学Py;ProDy公司;佩尔;生物钟;生物导体;MMTK公司;PyMOL公司;PyCogent公司;蟒蛇
引用于: 0个文档