ProDy公司 swMATH ID: 24072 软件作者： A.巴肯。 描述： ProDy：根据理论和实验推断的蛋白质动力学。摘要：我们开发了一个Python包ProDy，用于基于结构的蛋白质动力学分析。ProDy可以定量表征给定生物分子系统实验解析结构的异质数据集中的结构变化，并将这些变化与理论预测的平衡动力学进行比较。数据集包括给定蛋白质家族或亚家族、突变体和序列同源物在存在/不存在底物、配体或抑制剂的情况下的结构集合。许多辅助功能可以对实验和理论数据进行比较分析，并可视化不同功能状态下可获得的构象的主要变化。ProDy应用程序编程接口（API）的设计便于用户扩展软件和实施新方法。可用性：ProDy是开放源码的，在GNU通用公共许可下可从http://www.csb.pitt.edu/ProDy/。 主页： http://prody.csb.pitt.edu 依赖项： 蟒蛇 相关软件： MMTK公司；生物爪哇；生物蟒蛇；蟒蛇；数学软件；阿伯；犰狳；pdb工具；iScore公司；码头Q；ProFit程序；数字Py；MD分析；pdb2sql；Omics管道；水蟒；IPython公司；PyPI公司；生物红宝石；生物SQL 引用于： 2文件 标准条款 1出版物描述软件 年份 \textit{prody}：从理论和实验推断的蛋白质动力学艾哈迈特·巴坎；利迪奥·梅雷莱斯。；伊维特·巴哈尔 2011 4位作者引用 1 阿尔贾日·戈代克 1 阿莱西奥·拉波拉 1 兰加·萨尔卡 1 马克西米利安·沃塞尔 2篇连载文章中引用 1 数学生物科学 1 物理学报A：数学与理论 在2个字段中引用 1 统计力学，物质结构（82-XX） 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文