ProbABEL公司 swMATH ID: 10861 软件作者: 尤里·S·奥尔琴科(Yurii S Aulchenko);马克西姆五世(Maksim V Struchalin);科妮莉亚·范·杜伊恩 描述: 用于插补数据全基因组关联分析的ProbABEL包。背景:在过去几年中,全基因组关联(GWA)研究成为鉴定复杂性状相关基因座的一种选择工具。目前,GWA分析中经常使用插补单核苷酸多态性(SNP)数据。对插补数据的正确分析需要实施考虑到基因型插补不确定性的具体方法。结果:我们开发了ProbABEL软件包,分别用于分析线性、logistic和Cox比例风险模型下全基因组输入SNP数据和定量、二进制和时间-事件结果。对于数量性状,该软件包还对具有差异关系的样本进行了快速的基于混合模型的两步评分测试,以便于在基于家庭的研究、在人类遗传隔离群体和远交动物群体中进行的研究中进行分析。结论:ProbABEL软件包提供了在全基因组背景下分析输入数据的快速有效方法,并将有助于未来识别复杂性状位点。 主页: http://www.biomedcentral.com/1471-2105/11/134 相关软件: GenABEL公司;爆破;线性代数库;LAPACK公司;第1类;新加坡元-QN;取消锁定BoX;UCI-毫升;元素;SN版本;PLINK公司;Qxpak公司;艾根斯特拉;脉冲 引用于: 5文件 全部的 前5名7位作者引用 三 保罗·比伦蒂内西 三 迭戈Fabregat-Traver 1 埃利夫·阿卡尔(Elif F.Acar)。 1 尤里·奥琴科。 1 弗兰克,阿尔瓦罗 1 维瓦克·帕特尔 1 孙磊 4篇连载文章中引用 2 应用数学与计算 1 ACM数学软件汇刊 1 生物计量学 1 SIAM优化杂志 全部的 前5名在6个字段中引用 4 统计学(62-XX) 三 生物学和其他自然科学(92-XX) 2 数值分析(65-XX) 1 计算机科学(68至XX) 1 运筹学、数学编程(90-XX) 1 系统论;控制(93至XX) 按年份列出的引文