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科学代表。2016; 6: 32257.
2016年8月31日在线发布。 数字对象标识:10.1038/srep32257
预防性维修识别码:PMC5006047
PMID:27577858

N-乙酰-Seryl-天冬氨酰-Lysyl-Proline(Ac-SDKP)调控乙酰化α-管蛋白对二氧化硅诱导大鼠肺纤维化的抗纤维化作用

关联数据

补充资料

摘要

矽肺是中国最严重的职业病。本研究的目的是通过蛋白质组分析筛选与矽肺发病机制相关的各种蛋白质,这些蛋白质是N-乙酰-芳基-天冬氨酰-赖氨酰-脯氨酸(Ac-SDKP)抗纤维化作用的基础。我们还旨在探讨Ac-SDKP调节乙酰化α-微管蛋白(α-Ac-Tub)的潜在机制。采用双向电泳(2-DE)和基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF/TOF-MS)评估经或不经Ac-SDKP治疗的对照组和矽肺大鼠之间的不同蛋白质表达谱。29种蛋白质被鉴定为可能参与矽肺病的进展和Ac-SDKP的抗纤维化作用。我们目前的研究发现:1)Ac-Tub-α表达缺失可能是大鼠矽肺发病的新机制;2) N-乙酰-Seryl-Aspartyl-Lysyl-Proline(Ac-SDKP)治疗矽肺大鼠抑制肌成纤维细胞分化和胶原沉积,同时稳定α-Ac-Tub的表达体内在体外与脱乙酰酶家族成员6(HDAC6)和α-微管蛋白乙酰转移酶(α-TAT1)有关。我们的数据表明,Ac-SDKP对α-Ac-Tub的调节可能是一种新的抗纤维化机制。

最近,天然存在的四肽N-乙酰基-芳基-天冬氨酰-赖氨酰-脯氨酸(Ac-SDKP)被认为是一种有助于预防心血管炎症和纤维化的抗纤维化肽1,自身免疫2,肺部,肝脏4和肾脏疾病5在基础水平上,内源性Ac-SDKP可以拮抗和防止过度的胶原沉积。相反,慢性阻断Ac-SDKP可在促纤维化刺激物(如血管紧张素II(Ang II))的存在下促进和加速胶原蛋白的积累6据报道,结核性心包炎与正常心包液中Ac-SDKP水平低有关7此外,Ac-SDKP已被证明可抑制细胞增殖、肌成纤维细胞分化和胶原沉积,这些作用受转化生长因子β(TGF-β)信号和肾素-血管紧张素系统(RAS)等系统的调节1,2,,4,5,6,7这些观察结果表明Ac-SDKP具有抗纤维化作用,纤维化疾病至少部分是通过下调Ac-SDKP介导的。

在过去几年中,我们的研究重点是Ac-SDKP在矽肺大鼠模型中的抗纤维化作用。我们之前证明Ac-SDKP可以预防SiO诱导的肺纤维化2 体内在体外8,9其作用包括抑制慢性炎症、TGF-β信号诱导的成纤维细胞增殖、成纤维细胞分化为肌成纤维细胞和胶原合成。在本研究中,我们使用双向电泳(2-DE)分离大鼠肺组织中表达的蛋白质。使用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF/TOF MS)分析分离的蛋白质,并使用获得的光谱进行鉴定。

基于我们的蛋白质组分析结果,我们发现α-微管蛋白在矽肺诱导的肺纤维化中下调。Ac-SDKP治疗逆转了这种下调,表明α-微管蛋白可能在矽肺的发展和进展中起作用。α-微管蛋白在赖氨酸40(K 40)上的乙酰化是最早发现的微管蛋白翻译后修饰之一,用于调节微管内部蛋白和细胞内转运。α-微管蛋白由组蛋白脱乙酰酶家族成员6(HDAC6)脱乙酰化,并由α-微管蛋白乙酰转移酶(α-TAT1或Mec-17)乙酰化10乙酰化α-微管蛋白(α-Ac-Tub)被用作纤毛细胞的标记物,并显示出清除呼吸道粘液的能力11在本研究中,确定了α-Ac-Tub在矽肺大鼠模型中的特异表达和位置,这些问题在以前的研究中很少得到解决。此外,微管系统和肌动蛋白细胞骨架被发现参与肌成纤维细胞分化、组织重塑和器官纤维化的调节12在本研究中,我们探索了1)与经Ac-SDKP治疗的矽肺大鼠相关的差异蛋白谱;2) α-Ac-Tub在大鼠矽肺模型中的表达动态;和3)根据Ac-SDKP的抗矽肺作用,特别是Ang II诱导的肌成纤维细胞分化的抑制,HDAC6和α-TAT1调节α-Ac-Tub的差异表达。

结果

Ac-SDKP对矽肺大鼠模型作用的比较蛋白质组学分析

大鼠肺部H&E染色结果如所示图1a在疾病模型中(4w和8w) 组,我们观察到矽肺结节和间质纤维化区域,这些病理变化在Ac-SDKP治疗前后组均得到缓解。使用2-DE分析和MALDI-TOF-MS对每组6个样品进行分析。使用ImageMaster 2D Platinum Software 6.0版,在2-DE凝胶中共鉴定出2700个蛋白质(1400个可溶性蛋白质和1300个不溶性蛋白质)(补充表S1). 如所示图1,,2-DE2-显示了代表大鼠肺组织的DE模式,并分布在pI 4.0–8.0的区域,分子量为14–97千帕。与对照组相比(4w和8w) 、矽肺模型组(4w和8w) Ac-SDKP治疗组(治疗前后)显示(图1b)和22种不溶性蛋白质(图1c)差异表达。成功获得了所有29个蛋白点的肽质量指纹图谱(PMF),其吉祥物分析结果和差异表达模式列于补充表S1-4.

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大鼠病理观察及双向电泳。

()如图所示,不同组肺中H.E染色的代表性显微照片。比例尺=====================================================================================================200μm和50微米。(b条)对可溶性蛋白质提取物进行一维分析(pH 3–10 NL IPG,24厘米);第二个维度是在垂直平板(13%T)凝胶上进行的。蛋白质检测采用考马斯胶染色。(c(c))不溶性蛋白质提取物的2-DE部分。编号是指矽肺模型中差异表达的蛋白质点,然后将其切除、消化并通过MS程序识别,如表S1-4.

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Tub-α和α-Ac-Tub在肺组织和成纤维细胞中的共同表达。

()免疫荧光法检测Tub-α和α-Ac-Tub在大鼠矽肺模型肺和AngⅡ诱导的成纤维细胞中的共表达。比例尺=====================================================================================================100μm和50微米。(b条)肺组织中α-Ac-Tub/vimentin的联合表达。比例尺=====================================================================================================100微米。(c(c))α-Ac-Tub/SP-A在肺组织中的联合表达。比例尺=====================================================================================================100微米。(d日)用两种不同的商业抗体免疫组织化学法检测矽肺中α-Ac-Tub的表达。比例尺=====================================================================================================200μm和50微米。

基因本体(GO)分析用于评估已识别蛋白质的GO分布。在“分子功能”组中,识别出的具有结合功能的蛋白质(蛋白质、离子、GTP、ATP、酶和受体)排名第一。在“生物过程”类别中,参与细胞增殖和凋亡的蛋白质,或对刺激、运输、代谢和信号通路作出反应的蛋白质,在已鉴定的蛋白质中占很大比例。上述数据表明,相关功能在矽肺纤维化和Ac-SDKP的抗纤维化作用中很重要(补充表S5).

用Western blot分析进一步验证了2-DE凝胶中层粘连蛋白A(SB2)和热休克蛋白60(SB3)的蛋白表达模式,结果与2-DE中观察到的结果相似。与对照组相比(4w和8w) 矽肺模型组HSP60表达增加,层粘连蛋白A表达减少(4w和8w) ●●●●。与矽肺8相比,Ac-SDKP治疗后和治疗前两组的这些蛋白质变化都得到了逆转w组(补充图S2A) 。我们还通过免疫荧光和Western blot检测了SB10(ADRB-Gs蛋白复合物)的表达。如所示补充图S1矽肺组Gs表达降低。

α-Ac-Tub在矽肺大鼠和AngⅡ诱导的成纤维细胞中的表达

此外,我们验证了另一种与Ac-SDKP抗纤维化作用相关的差异表达蛋白SA4(α-Tub)。出乎意料的是,验证结果与2-DE结果不一致。两种不同的机制可以调节微管多样性以适应多种细胞功能。一种机制是存在特定的微管蛋白同种型,另一种机制是翻译后修饰(PTMs),其中乙酰化先前已被确定为对α-微管蛋白的重要作用10。如所示图2a,Ang II诱导的成纤维细胞中α-Ac-Tub表达下调24h.免疫荧光显示α-Ac-Tub和α-Tub的共表达表明,α-Ac-Tub在肺组织的肺泡壁中表现出特异性表达。与α-Tub的弥漫表达不同,在矽肺结节中观察到α-Ac-Tub表达的特异性缺失。

α-Ac-Tub在成纤维细胞中的阳性表达13,14,上皮细胞15,16和内皮细胞17,18来自肺组织在体外所有这些细胞类型都被认为是肌成纤维细胞的潜在来源19为了初步确定哪种细胞类型阳性表达α-Ac-Tub,我们用免疫荧光染色法检测了α-Ac-Tub与间充质标记物波形蛋白或肺泡II型细胞的生物标记物SP-A的共同表达。如所示图2bα-Ac-Tub与SP-A或波形蛋白在肺组织的肺泡壁共表达阳性,提示在肺泡Ⅱ型细胞和间充质细胞中可以检测到α-Ac-Tub的阳性表达。在矽肺结节中,SP-A或α-Ac-Tub呈散在或弱表达,波形蛋白呈强表达,但不伴有α-Ac-Tub的共表达。为了消除这些抗体的潜在混杂效应,使用了两种不同的商业抗体,并获得了大鼠肺组织中α-Ac-Tub的类似表达模式(图2c).

Ac-SDKP稳定大鼠矽肺模型中α-Ac-Tub的表达

为了更好地说明微管乙酰化和肌成纤维细胞分化之间相互作用的作用,我们使用IHC检测了α-Ac-Tub和α-SMA在大鼠模型中的位置和表达。如所示图3a,与我们之前的研究类似8α-SMA在对照组的血管和气管平滑肌细胞中呈阳性染色,而在间质中未见阳性染色。在矽肺模型的矽肺结节和间质纤维化区域观察到α-SMA的特异性表达。相反,对照组动物接受了不含SiO的盐水治疗2诱导后,大多数检测到的α-Ac-Tub在气道上皮中表达,与以前的报告类似11; 如前所述,α-Ac-Tub也出现在肺泡细胞的多种细胞类型中20在矽肺结节或间质纤维化区域,即使在α-SMA阳性表达的区域,也未观察到α-Ac-Tub的阳性表达。

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Ac-SDKP对矽肺大鼠col I、α-SMA和α-Ac-Tub的影响。

()免疫组织化学法检测肺组织中α-SMA和α-Ac-Tub的表达。比例尺=====================================================================================================200μm和50微米。(b条)Western blot检测肺组织中col I、α-SMA和α-Ac-Tub的表达。数据表示为平均值±扫描电镜;N个=====================================================================================================4个独立实验。

免疫染色结果用Western blot分析进一步证实(图3b)表明在矽肺模型中(4w和8w) 与对照组相比,二氧化硅诱导组α-SMA表达增加,同时α-Ac-Tub表达减少(4w和8w) ●●●●。综上所述,这些结果表明肌成纤维细胞分化可能导致微管破裂。

Ac-SDKP减弱Ang II诱导的成纤维细胞中α-Ac-Tub的表达损失

类似于TGF-β1的作用8,Ang II治疗24小时后h、 大鼠肺成纤维细胞出现形态学改变,包括细胞变宽,α-SMA强阳性表达,α-Ac-Tub表达降低(图4). 这一发现表明,成纤维细胞分化为肌纤维母细胞样表型,微管断裂。Ang II治疗后,α-SMA和col I蛋白显著上调,α-Ac-Tub显著下调。为了专门检测Ac-SDKP的抗纤维化作用,我们合成了突变体Ac-ADKP,其中Ser被Ala取代,从而产生Ac-SDKP的非功能类似物。如所示补充图S2Ac-SDKP强烈抑制col I和α-SMA的表达,并稳定Ang II诱导的α-Ac-Tub的表达。

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Ac-SDKP对Ang II诱导的成纤维细胞col I、α-SMA和α-Ac-Tub的影响。

()免疫荧光法检测AngⅡ诱导的成纤维细胞中α-SMA和α-Ac-Tub的共同表达。比例尺=====================================================================================================50微米。(b条)通过Western blot测定Ac-SDKP、缬沙坦(AT1抑制剂)、TCS HDAC6 20b(特异性HDAC6抑制剂)和Y-27632(ROCK抑制剂)对成纤维细胞的影响。数据表示为平均值±扫描电镜;N个=====================================================================================================4个独立实验。

Ac-SDKP抑制HDAC6的表达在体外体内

先前的研究表明,微管脱乙酰化可能主要受HDAC6调节10在本研究中,我们还发现Ang II对肌成纤维细胞分化和ECM沉积的影响可能涉及Ang II受体1型(AT1),尽管没有证据表明HDAC6通过AT1激活。为了测试这些机制在HDAC6作用中的潜在参与,我们使用了相应受体和酶的药理抑制剂。缬沙坦(AT1抑制剂)、TCS HDAC6 20b(特定HDAC6抑制剂)治疗14,15)和Y-27632(一种Rho-相关卷曲形成蛋白激酶(ROCK)抑制剂)导致α-Ac-Tub重新分布,并减弱Ang II诱导的α-SMA和col I上调。Ac-SDKP治疗显示出类似的结果,并抑制AT1和p-MYPT的表达(图4).

此外,我们观察了HDAC6和HSP90在矽肺大鼠体内的表达和定位。如所示图5a在大鼠肺中,矽肺结节增加了HDAC6和HSP90的表达。体内在体外HDAC6和HSP90在矽肺组和AngⅡ诱导的成纤维细胞中表达上调。在Ac-SDKP治疗前后,大鼠HDAC6表达降低。此外,Ac-SDKP、缬沙坦、TCS HDAC6 20b和Y-27632治疗可减轻Ang II诱导的成纤维细胞HDAC6表达升高(图5b).

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Ac-SDKP对HDAC6表达的影响体内在体外.

()用免疫组织化学方法检测肺组织中HDAC6和HSP90的表达。比例尺=====================================================================================================50微米。免疫荧光法检测大鼠矽肺肺组织中HDAC6/α-Ac-Tub和HDAC6/-α-SMA的共同表达。比例尺=====================================================================================================100微米。(b条)Ac-SDKP对HDAC6和HSP90表达的影响体内在体外用Western blot测定。数据表示为平均值±扫描电镜;N个=====================================================================================================4个独立实验。

Ac-SDKP调节α-TAT1的表达在体外体内

如所示图6aα-TAT1在整个肺泡细胞的多种细胞类型中均呈阳性染色。在矽肺结节或间质纤维化区域,即使在α-SMA阳性表达的区域,也没有观察到α-TAT1的阳性表达。使用蛋白质印迹分析进一步证实了免疫染色结果,其中用Ac-SDKP预处理和后处理逆转了二氧化硅诱导的α-TAT1的表达减少。此外,Ac-SDKP和缬沙坦治疗逆转了Ang II诱导的成纤维细胞α-TAT1表达的降低。图6b显示用α-TAT1siRNA处理成纤维细胞以敲低α-TAT1导致α-TAT1和α-Ac-Tub减少,同时α-SMA和Col I的表达增加。相反,α-TAT1的过度表达导致相反的效果。此外,α-TAT1siRNA敲除部分阻断了Ac-SDKP对Ang II诱导的成纤维细胞Col I和α-SMA的抑制作用(图6c). 如中所示图6cα-TAT1的过表达抑制了Ang II诱导的Col I和α-SMA的表达增加,与Ac-SDKP共同孵育延长了pEX-2的抑制作用。这些结果表明,α-TAT1的过表达对Ang II和Ac-SDKP有反应。

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Ac-SDKP调节α-TAT1的表达在体外体内.

()免疫组织化学法检测肺组织中α-TAT1的表达。比例尺=====================================================================================================50微米。Ac-SDKP对α-TAT1表达的影响体内在体外用Western blot测定。数据表示为平均值±扫描电镜;N个=====================================================================================================4个独立实验。(b条)Western blot检测α-TAT1过表达或沉默对成纤维细胞col、α-SMA、α-TAT 1和α-Ac-Tub的影响。数据表示为平均值±扫描电镜;N个=====================================================================================================3个独立实验。(c(c))Western blot检测Ang II和Ac-SDKP处理的成纤维细胞中α-TAT1过表达或沉默对col、α-SMA、α-TAT 1和α-Ac-Tub的影响。数据表示为平均值±扫描电镜;N个=====================================================================================================3个独立实验。

讨论

我们小组以前曾报道过Ac-SDKP对矽肺有有益作用,包括TGF-β1和Ang II信号的减弱、肺成纤维细胞增殖和胶原合成通过c-Jun N末端激酶(JNK)信号传导以及血清反应因子(SRF)对肌成纤维细胞分化的调节8,9其他研究组也发现Ac-SDKP可以抑制包括心脏、肾脏、肝脏和肺在内的器官的纤维化。此外,Ac-SDKP还具有抗炎、抗凋亡、抗纤维化和促血管生成等多种功能;因此,它可能是新型抗纤维化药物的候选靶分子21为了提高我们在大鼠矽肺模型中识别受Ac-SDKP影响的潜在生物标记物的能力,我们使用2-DE/MS技术来识别矽肺的新生物标记物和Ac-SDKP的靶蛋白。在本研究中,我们发现了29种独特的蛋白质,它们在矽肺大鼠模型组或Ac-SDKP治疗组中的表达发生了显著变化,其功能以前在器官纤维化领域,特别是在矽肺疾病中尚未被探索。

目前的研究结果揭示了微管破裂与矽肺形成和发展之间的联系。在胎儿肺成纤维细胞(FLFs)、成人肺成纤维蛋白(ALFs)和IPF肺成纤维素(ILF)细胞系中,TGF-β1可诱导Col I上调、肌成纤维细胞分化和细胞增殖,并可降低α-Ac-Tub的表达18在肺组织中,α-Ac-Tub已被确定为气管上皮纤毛细胞的标志物,在氯暴露后修复气管时脱落或减少22和双乙酰滴注17在本研究中,我们发现α-Ac-Tub在气道上皮细胞中呈强阳性表达。然而,在肺泡壁细胞中观察到阳性表达。更有趣的是,在矽肺结节中观察到α-Ac-Tub表达的缺失,这些结节被α-SMA标记的肌成纤维细胞显著占据。在肺纤维化中,肌成纤维细胞可以与成纤维细胞、血管周围细胞、纤维细胞和来自上皮-间充质转化(EMT)的细胞分化19我们的研究表明,α-Ac-Tub与肺泡表面活性物质(SPA,II型肺泡上皮细胞的标记物)和波形蛋白(间充质细胞的标记)共同表达。这一发现表明,α-Ac-Tub在肺泡上皮细胞、成纤维细胞和内皮细胞中广泛表达,当细胞分化为肌成纤维细胞时,这种表达消失。此外,微管聚合已被证实通过控制肌动蛋白应激纤维/巨核细胞白血病-1(MKL1)/SRF信号而非Smad依赖性基因转录,在肌成纤维细胞分化中发挥作用12在之前的一项研究中,我们发现Ac-SDKP可以减弱TGF-β1/SRF信号诱导的肌成纤维细胞分化和胶原沉积8在当前研究中,我们发现Ac-SDKP通过上调α-Ac-Tub来抵消Ang II的促纤维化作用。这些数据提供了Ac-SDKP抗矽肺作用及其与肾素-血管紧张素系统(RAS)相互作用的新机制。

此外,α-Tub的乙酰化是一种常见的翻译后修饰,可被组蛋白脱乙酰酶家族成员6(HDAC6)和SIRT2抑制10研究表明,暴露于TGF-β1的人肺II型上皮细胞系(A549)中α-Tub的HDAC6依赖性脱乙酰化可诱导EMT通过在TGF-β1刺激的人肺动脉内皮细胞和成纤维细胞的原代培养中观察到Smad信号和对α-Ac-Tub的不同反应23也有报道称,ROCK增加HDAC6的活性,随后α-Tub乙酰化减少,并促进细胞增殖和迁移24,25在本研究中,我们还观察到Ang II诱导导致α-SMA、Col I和HDAC6的上调,以及α-Ac-Tub的下调。Ac-SDKP、缬沙坦、TCS HDAC6 20b和Y-27632预处理可阻断肌成纤维细胞的分化,下调Col I和HDAC6的表达,上调培养的成纤维细胞中的α-Ac-Tub。此外,作为HDAC6的经典底物,HSP 90被HDAC6脱乙酰化激活,其抑制剂具有抗纤维化作用26,27,28我们还发现,HDAC6和HSP 90的表达主要见于矽肺病变,并与α-SMA共同表达。此外,Ac-SDKP治疗抑制了矽肺大鼠和Ang II诱导的成纤维细胞HSP 90的上调。这些结果表明,Ac-SDKP通过抑制HSP 90的活性和稳定α-Ac-Tub的表达,对HDAC6在肺纤维化中的作用具有潜在作用。

然而,HDAC6对α-Ac-Tub并不是完全选择性的,并且具有去乙酰化酶无关的功能。相反,乙酰转移酶α-TAT1在赖氨酸40上特异性地乙酰化α-Tub10.培养中α-TAT1−/−成纤维细胞,增殖增加与接触抑制不足有关29在本研究中,我们还发现,α-TAT1的siRNA敲低导致α-SMA表达增加,而α-TTA1的过度表达则显示了相反的效果。同时,α-TAT1siRNA敲除还抑制了Ac-SDKP对肌成纤维细胞分化、胶原合成和α-Ac-亚基稳定的抗纤维化作用。总之,我们的研究结果表明,Ac-SDKP调节HDAC6和α-TAT1活性,从而导致α-Ac-Tub表达显著增加,阻止肌成纤维细胞分化和胶原沉积。

方法

动物

根据既定指南进行动物护理和治疗。这些方案得到了华北科技大学动物护理委员会的批准(2013-038)。特定无致病性雄性Wistar大鼠(3周龄;体重180±10g) 购自Vital River Laboratory Animal Technology Co.,Ltd.(SCXY 2009-0004,中国北京)。根据华北科技大学制定的指南,这些大鼠被安置在一个12小时光/暗循环的温度控制设施中,并接受食物和水。

矽肺病模型

实验方案和矽肺病模型如前所述8简单地说,用异氟醚麻醉大鼠,并接受二氧化硅溶液(50mg/大鼠,1ml)或0.9%生理盐水(载体)经气管滴注。Ac-SDKP【800】μg/(kg d),美国Bachem AG公司]或对照组(0.9%生理盐水)通过一个微型透水泵(型号2ml 4,美国DURECT有限公司)植入腹腔。60只大鼠分为6组(每组10只):1)对照组4w(用0.9%生理盐水诱导;然后用0.9%的生理盐水处理4次周);2) 矽肺模型4w[矽肺诱发50毫克二氧化硅2(s5631,Sigma-Aldrich,St.Louis,MO,USA)在大鼠气管内,然后用0.9%生理盐水处理4次w] ;3) 控制8w(用0.9%生理盐水预诱导480.9%盐水诱导前h,然后用0.9%盐水处理8次w) ;4) 矽肺模型8w(用0.9%生理盐水预处理4850之前的h二氧化硅毫克2诱导,然后用0.9%生理盐水处理8次w) ;5) Ac-SDKP后处理(用SiO诱导2,用0.9%生理盐水治疗4次w、 然后用Ac-SDKP再治疗4次w) ;和6)Ac-SDKP预处理(在用SiO诱导前48小时用Ac-SDKP预处理2,然后继续Ac-SDKP治疗8w) ●●●●。在实验结束时,用0.9%的生理盐水冲洗肺组织,以在切除前除去血液,并在液氮中进行snap冷冻,以便随后提取蛋白质。

双向凝胶电泳(2-DE)样品制备

冷冻肺组织(每组6个)在液氮中研磨,并在含有40mM Tris、1%w/v DTT、1%v/v IPG缓冲液3–10NL和鸡尾酒蛋白酶抑制剂混合物(04693116001,罗氏),然后均质。样品匀浆在冰上培养30最小值,40000离心对于3014时最小摄氏度。向上清液中加入2M硫脲和7M尿素并标记“可溶性蛋白”。

剩余沉淀物用裂解缓冲液A洗涤两次,并重新悬浮在裂解缓冲液B(2M硫脲,7M尿素,40mM Tris、1%w/v DTT、1%v/v IPG缓冲液3–10 NL和鸡尾酒蛋白酶抑制剂混合物)。接下来,匀浆在40000下离心对于3014时最小°C,上清液被标记为“不溶性蛋白质”。

2-DE图像分析和蛋白质鉴定(MALDI-TOF-MS)

如前所述,遵循2-DE协议30蛋白质样品(1.3毫克,氮=====================================================================================================每组6个)加载到固定干条上(24个cm,pH值3–10 NL,GE Healthcare)。使用IPGphor-3(GE Healthcare),按照GE Healthcare提供的方案执行一维等电聚焦(IEF)。在缓冲器中平衡后[6M尿素,50mM Tris碱pH 8.8,30%(v/v)甘油,2%(w/v)SDS(十二烷基硫酸钠)]补充1%(w/v)DTT 15分钟,在添加2.5%(w/v)碘乙酰胺的同一缓冲液中进行第二次培养15分钟。然后将板条加载到Ettan DALT II系统中12%的SDS聚丙烯酰胺凝胶上(GE Healthcare)。使用考马斯蓝G-250(Amresco)染色对凝胶中的蛋白质进行可视化,并使用ImageMaster 2D Platinum Software 6.0版(GE Healthcare)进行扫描和分析。只有体积百分比变化至少1.5倍的斑点才被视为差异表达。

将表达发生显著变化的蛋白质从凝胶中取出,洗涤、脱水并用1050纳克/毫升胰蛋白酶(Promega)毫摩尔/升NH4HCO公司肽混合物放置在不锈钢MALDI探针上,并在室温下缓慢干燥。MS是使用Bruker Daltonics Autoflex MALDI-TOF-MS进行的。除非另有规定,否则质谱是在反射模式下检测的,并使用FlexControl软件(版本2.4,Bruker Doltonics)使用默认参数进行记录。除非另有规定,否则使用Xmass软件(5.1.1版,Bruker Daltonics)使用默认参数标记单等位肽质量。

使用Mascot搜索引擎完成MS数据中的蛋白质鉴定(www.matrixscience.com/cgi/search_form.pl?FORMVER=2&SEARCH=PMF)带有大鼠作为选定的分类法和为搜索选定的NCBI非冗余数据库。根据以下标准鉴定蛋白质31:(1)得分大于60分(第页 < 0.05,默认阈值);(2) MS数据覆盖的理论蛋白质序列比例大于20%;(3)与理论值相比,分子质量变化小于30%,pI变化小于2.0。

细胞培养

使用胰蛋白酶消化法从3周龄Wistar大鼠中分离出大鼠肺成纤维细胞,并将其保存在补充有10%胎牛血清(FBS,10099141,Gibco,Thermo Fisher Scientific)和100U/ml青霉素/链霉素]°C培养箱,含5%CO280%融合处的细胞在无FBS-MEM培养基中培养24小时小时,大多数细胞处于静止状态。接下来,将细胞分为6组,培养24小时小时数:1)控制;2) 100nmol/L Ang II(A9525,Sigma-Aldrich);3) 昂二世+10−8mol/L Ac-SDKP(H-1164,Bachem AG,瑞士);4) 昂二世 + 10−6mol/L缬沙坦(V0112,东京化学工业,日本东京);5) 昂二世 + 10−6mol/L TCS HDAC6 20b(4805,Tocris Bioscience,英国布里斯托尔);6) 昂二世 + 10−3mol/L Y-27632(10005583 m,Cayman Chemical Company,Ann Arbor,MI,USA)。

基因沉默和过度表达α-TAT 1

三个siRNA对抗α-TAT 1由广州瑞波生物科技有限公司合成。这些siRNA的序列为1)意义:5′GCAGCAAUCAUGACUAU dTdT 3′;反义:3′dTdT CGUCGUUAGUA CUGAUAA 5′;2) 意义:5′CCUCCAGUGAGAAUU dTdT 3′;反义:3′dTdT GGAGUCACUCUUAA 5′;3) 意义:5′GGAACCUACGCAUACAG UU dTdT 3′;反义:3′dTdT CCUGGAUGCGUAUGUCAA 5′。控制siRNA或α-TAT 1使用脂质体将siRNA转染到细胞中®2000试剂(11668,Invitrogen,Carlsbad,CA,USA),根据制造商的说明。然后,在使用Ang II或Ac-SDKP治疗之前,将细胞培养48小时。

的编码顺序α-TAT 1(1266 bp)被克隆到XhoI公司巴米希上海金玛药业科技有限公司瞬时表达载体pEX-2中的位点使用脂质体将空载体pEX-2-和pEX-2-α-TAT 1转染到细胞中®2000试剂(11668,Invitrogen,Carlsbad,CA,USA),根据制造商的说明。然后,在给予Ang II或Ac-SDKP处理之前,将细胞孵育48小时。

免疫细胞化学(ICC)和免疫组织化学(IHC)

在室载玻片和石蜡包埋的组织切片上生长的细胞用于ICC和IHC。用3%H淬灭内源性过氧化物酶2O(运行)2,并使用高压方法对脱蜡组织切片进行抗原提取。然后将样品与α-SMA(ab3275,Eptomics,Mitten,CA,USA)、α-Ac-Tub(sc-23950,Santa Cruz Biotechnology,USA或ab125356,Abcam,Cambridge,MA,USA,HDAC6(20183,Arigo biolaboratories,Shinchu,Taiwan,China)和HSP 90(BD Transduction Laboratories°C,然后与二级抗体(PV-6000,中国北京中山金桥生物科技有限公司)在37℃下孵育20°C用DAB(ZLI-9018,ZSGB-BIO,中国北京)观察最小免疫反应性。棕色染色被认为是阳性结果。

为了进行免疫荧光染色,用10%的驴血清(92590,Temecula,CA,USA)封闭腔玻片或石蜡包埋切片154时共同孵育过夜后的最小值°C,α-Ac-Tub/α-Tub(AF7010,Affinity Biosciences,辛辛那提,俄亥俄州,美国),α-Ac-Tub/波形蛋白(ab92547,Abcam)和α-Ac-Tub/肺表面活性物质相关蛋白A(SPA,EL925092型(英国伯明翰,Eterlife)、HDAC6/α-SMA和HDAC6/-α-Ac-Tub,用Alexa Fluor培养细胞®488驴抗兔IgG(H + 五十) (A21206,Molecular Probes,Carlsbad,CA,USA)和Novex®驴抗鼠TRITC亲和力(A16016,Molecular Probes,Carlsbad,CA,USA)或罗丹明标记的山羊抗兔IgG(H + 五十) (03-15-06,Kirkegard and Perry Laboratories,Gaithersburg,MD,USA)和荧光标记山羊抗鼠IgG(H + 五十) (02-18-06,Kirkegard and Perry Laboratories)用于60最小值为37阻塞缓冲器中为°C。细胞核用DAPI(C1002,Beyotime Biological Technology Co.,LTD,Jiangsu,China)染色。然后在奥林巴斯DP80显微镜下观察细胞或组织,并使用成像软件(cellSens 1.8,奥林巴斯公司,德国)进行分析。

蛋白质印迹分析

使用RIPA缓冲液(BB-3201-1,BestBio,中国上海)对细胞和肺组织进行裂解,并使用Bradford蛋白质分析法(PC0020,Solarbio;中国)对总蛋白质含量进行量化。蛋白质(20μg/lane)通过SDS-PAGE在10%的凝胶上分离,并电转移到硝化纤维素膜上(Amervicele Biosciences)。用5%脱脂乳封闭膜,并在4°C,带有一级抗体[抗I型胶原蛋白(ab34710,Abcam),抗α-SMA;抗α-Ac-Tub;抗α-Tub;抗AT1(DF7592,亲和生物科学);抗p-MYPT(AF5445,亲和生物学);抗MYPT,然后是对兔/小鼠IgG(H + 五十) (074–1506/074–1806,柯克加德和佩里实验室)。通过添加ECL显示目标带TM(TM)Prime Western印迹检测试剂(RPN2232,GE Healthcare,中国香港)。结果表示为α-Tub中的折叠变化。

统计分析

数值表示为平均值±SEM。使用单向方差分析对多个独立组进行比较,然后使用Bonferroni检验进行事后分析。与的组差异第页-小于0.05的值被认为具有统计学意义。

其他信息

如何引用这篇文章:小军,W。乙酰化α-管蛋白受N-乙酰基-Seryl-Aspartyl-Lysyl-Proline(Ac-SDKP)调节在二氧化硅诱导的大鼠肺纤维化中发挥抗纤维化作用。科学。代表。 6, 32257; doi:10.1038/srep32257(2016)。

补充材料

补充信息:
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致谢

本研究由国家自然科学基金(No.81202162)、河北省自然科学基金项目(No.H201409115)和河北省研究生创新基金项目(2015S03)资助。

脚注

作者贡献W.X.和L.Y.设计了这项研究。W.X.、L.Y.、L.S.、X.D.、G.X.、Z.L.和W.Z.进行了实验工作,分析了数据,并起草了手稿。Y.F.和X.H.参与了研究的设计,并对手稿进行了批判性审查,并提供了智力输入。Z.X.和D.B.参与了研究的设计,帮助起草和批判性审查了手稿,并提供了智力投入。所有作者阅读并批准了最终手稿。

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