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生物
结晶学
第59卷
|
第9部分
国际标准编号:1399-0047
2003年9月发行
封面插图:
半胱氨酸色氨酸醌氧化还原辅因子苯肼加合物在喹大蛋白胺脱氢酶中的蛋白质相互作用
恶臭假单胞菌
.C原子为灰色,N原子为青色,O原子为红色,S原子为绿色(
第1551页
).
研究论文
《水晶学报》。
(2003年)。
D类
59
,
1533-1538
网址:10.1107/S0907444903013027
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内电场对凝胶针刺法蛋白质结晶的影响
N.米尔金
,
B.A.Frontana-Uribe公司
,
A.罗德里格斯-罗梅罗
,
A.埃尔南德斯·桑托约
和
A.莫雷诺
在结晶过程中,利用溶菌酶和索姆丁凝胶针刺法评估了内电场对毛细管内晶体蛋白质结构的影响。
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《水晶学报》。
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1539-1544
doi:10.1107/S090744490301131
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翼状胬肉还原酶(PTR1)的结构
蜥蜴利什曼原虫
H.赵
,
T.布雷
,
M.Ouellette先生
,
M.赵
,
R.A.Ferre公司
,
D.马修斯
,
J.M.怀特利
和
K.I.Varughese公司
PTR1的晶体结构
塔伦塔雷乳杆菌
作为二元络合物,NADPH为2.8
利用最近报道的分子置换技术解决了光学分辨率问题
L.少校
PTR1结构作为搜索模型。
PDB参考
:
塔伦塔雷乳杆菌
PTR1、1p33、r1p33sf
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,
1545-1550年
doi:10.1107/S090744490301161
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空间群中的金黄色素B结构
P(P)
6
5
李先生
,
M.J.马赫
,
H.C.弗里曼
和
J.M.格斯
嗜热绿色光合细菌中的一种“蓝色”铜蛋白——金苷B的新晶型
金黄色念珠菌
,已精炼为1.9
奥分辨率。
PDB参考
:
金苷B,1ov8,r1ov8sf
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,
1551-1556
doi:10.1107/S090744490301429X
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喹大蛋白胺脱氢酶苯肼加合物的结构
脱氮副球菌
在1.7
奥数分辨率
S.达塔
,
T.池田
,
K.卡诺
和
F.S.马修斯
苯肼在喹大蛋白胺脱氢酶中的结合位点被确定为氧化还原辅因子半胱氨酸色氨酸醌的C6位置。
这一结果坚定地确立了C6是该酶催化转化过程中Schiff-base形成的位点。
PDB参考
:
喹大蛋白胺脱氢酶苯肼加合物,1pby,r1pbysf
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,
1557-1566
doi:10.1107/S0907444903014367
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权重估计和验证:边际似然法
A.A.列别捷夫
,
I.J.搔痒
,
R.A.拉斯科夫斯基
和
D.S.莫斯
基于加权参数的边际似然函数的近似,提出了一种约束大分子精细化的权重估计方法,该方法使用了所有的X射线数据。
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1567-1573
doi:10.1107/S0907444903014562
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高亲和力链霉亲和素-生物素复合物中氢键的结构研究:与生物素脲基氧相互作用的氨基酸突变
一、乐荣
,
S.弗赖塔格
,
L.A.Klumb公司
,
五、楚
,
P.S.斯塔顿
和
R.E.斯坦坎普
能够与生物素氢键的链霉亲和素残基突变导致该蛋白质/配体系统的结合常数发生显著变化。
结构分析表明,生物素与突变蛋白复合物的三维结构几乎没有变化。
PDB参考
:
链霉亲和素突变体N23A,1n4j,r1n4jsf
;
N23A,1n43,r1n43sf的生物素复合物
;
突变体N23E,1n7y,r1n7ysf
;
突变体S27A,1n9y,r1n9ysf
;
S27A、1n9m、r1n9msf的生物素复合物
;
突变型Y43A,1nbx,r1nbxsf
;
Y43A,1nc9,r1nc9sf的2-亚氨基二肽复合物
;
突变体Y43F,1swu,r1swusf
;
Y43F,1ndj,r1ndjsf生物素复合物
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59
,
1574-1581
doi:10.1107/S0907444903014598
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眼镜王蛇磷脂酶a的结构
2
由半面体孪晶确定
S.Xu先生
,
L.Gu先生
,
Q.王
,
Y.Shu先生
,
S.宋
和
Z.林
2.1版
眼镜王蛇PLA的光学分辨率结构
2
由完全半面体孪晶的分子替换确定,并与同源PLA的结构进行比较
2
来自同一种毒液。
PDB参考
:
哦
APLA公司
2
-二、 1m8吨,r1m8tsf
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(2003年)。
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,
1582-1588
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的结构
发酵红酵母
MAD溶解的高电位铁硫蛋白
A.冈萨雷斯
,
S.贝尼尼
和
S.Ciurli公司
本文描述了结构解和合成模型
发酵乳杆菌
HiPIP,一种具有高还原潜力的细菌铁硫蛋白。
PDB参考
:
发酵乳杆菌
HiPIP,1hlq,r1hlqsf
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(2003年)。
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59
,
1589-1596
doi:10.1107/S0907444903014719
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单斜胍基乙酸甲酯转移酶和钆离子结合特性
J.小本
,
Y.高田
,
T.山田
,
科尼西
,
H.小川
,
T.戈米
,
藤冈先生
和
F.高川
测定了单斜修饰中胍基乙酸甲基转移酶的晶体结构,其中四个亚基中的三个亚基具有含有Tyr136的催化不利环。
通过对Gd离子结合位点的分析,揭示了Gd-离子结合的特征,可能有助于制备用于相位调整的重原子衍生物。
PDB参考
:
胍基乙酸甲基转移酶,1p1b,r1p1bsf
;
Gd导数,1p1c,r1p1csf
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(2003年)。
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59
,
1597-1602
doi:10.1107/S0907444903014902
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苯酚羟化酶的高分辨率结构及其序列错误的校正
C.恩罗斯
收集了苯酚羟化酶的新衍射数据。
细化至1.7
解决方案导致最终释放
R(右)
系数为18.0%。
该模型还针对之前的11个测序错误进行了校正。
PDB参考
:
苯酚羟化酶,1pn0,r1pn0sf
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,
1603-1609
doi:10.1107/S09074449903014963
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5-甲基-6的三种晶体结构测定分析-
N个
-甲基苯胺嘧啶与人二氢叶酸还原酶的抗叶酸复合物
V.科迪
,
J.R.勒夫特
,
W.A.庞本
和
A.冈吉
报道了强效消泡剂抑制剂2,4-二氨基-5-甲基-6-[(3′,4′,5′-三甲氧基-
N个
-甲基苯胺)甲基]吡啶[2,3-
d日
]嘧啶(1)与人二氢叶酸还原酶(hDHFR)和NADPH的复合物。
PDB参考
:
R(右)
3-1,第1页,第1页
;
R(右)
3-2,第1页,第1页
;
P(P)
4
三
2
1
2格,1pdb,r1pdb
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(2003年)。
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59
,
1610-1618
doi:10.1107/S09074449903014975
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的结构
嗜热菌
甘氨酸洗涤系统的HB8 H蛋白,用六维分子置换法解析
T.Nakai公司
,
J.石岛
,
R.Masui先生
,
S.Kuramitsu公司
和
北神宫
由于紧密堆积的单细胞内有大量分子,这种结构通过六维分子替换得以解决。
与豌豆中的对应物相比,揭示了可能参与分子间相互作用的高度保守区域。
PDB参考
:
嗜热杆菌
H蛋白,1onl,r1onlsf
阅读文章
《水晶学报》。
(2003年)。
D类
59
,
1619-1627
doi:10.1107/S090744490301130
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1536孔板亚微升蛋白质结晶试验的自动分类
C.A.Cumbaa公司
,
A.劳丽塞拉
,
N.费尔曼
,
C.威奇
,
R.柯林斯
,
J.R.勒夫特
,
G.德提塔
和
一、法理学
描述了一种自动评估微批次(亚微升滴)蛋白质结晶试验的技术。
阅读文章
结构基因组学论文
《水晶学报》。
(2003年)。
D类
59
,
1628-1631
doi:10.1107/S0907444903016779
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SARS冠状病毒结构基因组学:Nsp9蛋白的克隆、表达、结晶和初步晶体学研究
V.坎帕纳奇
,
M.-P.埃格洛夫
,
S.Longhi公司
,
F.费隆
,
C.Rancurel公司
,
A.所罗门群岛
,
C.杜鲁索
,
F.托克
,
N.布列蒙
,
J.C.多布
,
E.J.斯奈德
,
B.卡纳德
和
C.坎比劳
已开发出SARS-CoV全基因组方法,旨在确定其所有蛋白质或结构域的晶体结构。
这里,克隆,
大肠杆菌
报道了SARS-CoV Nsp9蛋白的表达、纯化和结晶,这是第一个结晶的SARS-CoV蛋白。
阅读文章
结晶纸
《水晶学报》。
(2003年)。
D类
59
,
1632-1634
doi:10.1107/S0907444903013660
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伴侣蛋白GroEL–GroES复合物的结晶
嗜热菌
HB8型
岛村T
,
A.Koike-Takeshita
,
K.横山由纪夫
,
吉田先生
,
H.田口
和
岩手南部
天然GroEL-GroES复合物是从
嗜热杆菌
HB8并结晶。
三斜晶衍射到3.0
奥分辨率。
阅读文章
《水晶学报》。
(2003年)。
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59
,
1635-1636
doi:10.1107/S09074449030115X
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蝎子重组α-昆虫毒素rBmKαIT1的结晶及初步晶体学研究
东亚钳蝎
卡尔希
Y.Huang(黄)
,
Q.黄
,
H.陈
,
Y.唐
,
H.三宅一生
和
库苏诺基先生
蝎子的α-昆虫毒素
B.马氏体
Karsch已经被表达、纯化和结晶。
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(2003年)。
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59
,
1637-1639
doi:10.1107/S0907444903011100
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阿克拉霉素-10-甲基酯酶和阿克拉霉素-10-羟化酶的结晶和初步X射线衍射研究
紫色链霉菌
A.詹森
,
J.尼米
,
P.Mäntsälä
和
G.施耐德
适用于蒽环类生物合成途径中两种酶结构测定的晶体
链霉菌
已培养出阿克拉霉素10-甲基酯酶和阿克拉霉素10-羟化酶。
阅读文章
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,
1640-1641
doi:10.1107/S090744490301112
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磷酸烯醇丙酮酸羧激酶的结晶和初步X射线晶体学研究
谷氨酸棒杆菌
S.Aich公司
,
F.Imabayashi(音)
和
L.T.J.德尔巴雷
磷酸烯醇丙酮酸羧激酶(PCK)是参与糖异生调控的关键酶。
C.谷氨酸
PCK已结晶,X射线衍射数据已收集到2.8
奥分辨率。
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,
1642-1644
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ClpX的纯化、结晶和初步X射线研究
幽门螺杆菌
D.Y.Kim(D.Y.金)
,
C.A.吴
,
D.R.Kim博士
,
S.C.哈
,
Y.-H.韩
和
K·K·金
ClpX来自
幽门螺杆菌
已经过表达、纯化和结晶。
晶体衍射到2.6
奥分辨率。
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(2003年)。
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59
,
1645-1647
doi:10.1107/S0907444903014641
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可能的ATP硫酰化酶的过度生产、结晶和初步X射线衍射分析
嗜热菌
HB8型
Y.田口
,
J.胡塞基
,
Y.卡库塔
和
K.Fukuyama(福山)
一种可能来自
嗜热杆菌
HB8在
大肠杆菌
在腺苷-5′-硫酸磷存在下结晶。
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1648-1650年
doi:10.1010/S0907444903014616
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水稻核苷二磷酸激酶的纯化、结晶及初步X射线晶体学分析
J.-Y.黄
,
C.-Y.Chang
,
张灼祥
和
C.-J.Chen先生
从水稻中获得了核苷二磷酸激酶晶体。
阅读文章
《水晶学报》。
(2003年)。
D类
59
,
1651-1652
doi:10.1107/S0907444903014720
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赖氨酸生物合成LysX蛋白的克隆、表达、纯化、结晶和初步晶体学分析
嗜热菌
HB8型
M.N.瓦西里耶娃
,
H.酒井
,
松浦泰明
,
S.Sekine公司
,
西山先生
,
T.Terada公司
,
M.Shirouzu先生
,
S.Kuramitsu公司
,
D.G.Vassylyev(D.G.瓦西里耶夫)
和
横山由纪夫
LysX蛋白,参与
嗜热杆菌
克隆、表达、纯化和结晶。
收集了2.5和3.1两种晶型的完整衍射数据集
奥分辨率。
目前正在确定结构。
阅读文章
《水晶学报》。
(2003年)。
D类
59
,
1653-1655
doi:10.1107/S0907444903014896
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辅酶F
420
-依赖性亚甲基四氢甲烷蝶呤脱氢酶
坎德利草属
:硒代蛋氨酸标记酶和非标记酶以两种不同的形式结晶
C.H.Hagemeier先生
,
S.Shima公司
,
E.沃肯廷
,
R.K.托尔
和
U.埃姆勒
产甲烷的F
420
-已表达、纯化并结晶了依赖性亚甲基-H4MPT脱氢酶。
硒代蛋氨酸标记酶的晶体衍射为1.5
奥分辨率。
阅读文章
《水晶学报》。
(2003年)。
D类
59
,
1656-1658
doi:10.1107/S0907444903018316
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NtrC同系物的X射线晶体学特征和相位
L.萨尔莱
,
J.亨德尔
和
P.A.塔克
ZraR(HydG)响应调节器的两域结构
鼠伤寒沙门氏菌
已结晶,衍射数据记录为3.0
奥分辨率。
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《水晶学报》。
(2003年)。
D类
59
,
1659-1661
doi:10.1107/S0907444903015397
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木聚糖酶10B的结晶和初步X射线研究
海洋热藻
伊萨纳瓦蒂
,
库马萨卡
,
T.卡内科
,
C.莫罗库马
,
S.Nakamura公司
和
N.田中
超嗜热木聚糖酶10B来自
马里蒂玛锥虫
MSB8已结晶。
收集的完整衍射数据集高达2.5
奥分辨率。
阅读文章
《水晶学报》。
(2003年)。
D类
59
,
1662-1664
doi:10.1107/S0907444903015464
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无机聚磷酸盐/ATP-葡甘露糖激酶的结晶及初步X射线分析
节杆菌属
sp.菌株KM
T.穆凯
,
S.卡瓦伊
,
森喜朗(S.Mori)
,
B.米卡米
和
K.村田
无机聚磷酸[poly(P)]/ATP葡甘露聚糖激酶的结晶和初步X射线数据
节杆菌属
sp.菌株KM。
阅读文章
《水晶学报》。
(2003年)。
D类
59
,
1665-1667
doi:10.1107/S0907444903015452
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纯化、结晶和初步衍射研究
铜绿假单胞菌
K122-4单体菌毛
G.F.奥德特
,
R.T.欧文
和
B.雾气
单体菌毛的表达、纯化、结晶及X射线衍射初步研究
铜绿假单胞菌
报道了菌株K122-4。
阅读文章
《水晶学报》。
(2003年)。
D类
59
,
1668-1669
doi:10.1107/S0907444903015476
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重组二氨基丙酸解氨酶的结晶和初步X射线衍射研究
大肠杆菌
V.拉贾拉姆
,
J.拉贾加纳帕蒂
,
F.汗
,
H.S.萨维提里
和
M.R.N.Murthy先生
PLP依赖酶二氨基丙酸解氨酶
大肠杆菌
以两种形式结晶。
单斜(
P(P)
2
1
)和正方的(
P(P)
4
1
2
1
2或
P(P)
4
三
2
1
2) 形成2.5和3.0倍的衍射X射线
分别为?分辨率。
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《水晶学报》。
(2003年)。
D类
59
,
1670-1673
doi:10.1107/S090744490301094
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家蚕细胞体Ⅱ型粘蛋白结构域的初步X射线表征和定相
纤维素溶醋弧菌
I.诺亚
,
R.拉米德
,
Q.徐
,
S.Rosenheck公司
,
L.J.W.西蒙
,
E.A.拜耳
和
F.弗罗洛
来自细胞体系统的II型粘蛋白的天然和SeMet衍生物
A.纤维素分解菌
已经以三角形式表达、纯化和结晶。衍射数据收集到1.90
Å.
此外,获得了天然蛋白质的正交晶体,衍射为1.2
Å.
使用SIRAS和分子替换相结合的方法求解结构。
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《水晶学报》。
(2003年)。
D类
59
,
1674年至1675年
doi:10.1010/S0907444903015816
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结晶和初步晶体学研究
大肠杆菌
CcmG/DsbE蛋白
欧阳北区
,
W.-Y.Chen先生
,
Q.李
,
Y.-G.高
,
胡海燕
和
Z.-X.夏
大肠杆菌
CcmG/DsbE已使用蒸汽扩散技术结晶,X射线数据已收集到1.9
奥分辨率。
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《水晶学报》。
(2003年)。
D类
59
,
1676-1678
doi:10.1107/S0907444903014306
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哺乳动物肿瘤相关抗原UK114的结构和寡聚状态
D.德流
,
C.布赖恩
,
E.米斯丁烯
,
V.纳克蒂尼斯
和
M.G.Grütter先生
UK114的晶体结构已经确定,显示出三聚体排列。
超速离心研究证实UK114也是溶液中的三聚体。
PDB参考
:
英国114,1nq3,r1nq3sf
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