GCTA公司 swMATH ID: 23135 软件作者: Yang J、Lee SH、Goddard ME、Visscher PM 描述: GCTA:全基因组复杂性状分析工具。对于大多数人类复杂疾病和特征,全基因组关联研究(GWAS)确定的SNP只能解释一小部分遗传力。在这里,我们报告了一种用户友好的软件工具,称为全基因组复杂性状分析(GCTA),它是根据我们最近开发的一种方法开发的,用于解决“缺失遗传性”问题。GCTA估计一个复杂性状的染色体或整个基因组上所有SNP解释的方差,而不是测试任何特定SNP与该性状的关联。我们介绍了GCTA的五个主要功能:数据管理、SNP遗传关系估计、SNP解释方差的混合线性模型分析、连锁不平衡结构估计和GWAS模拟。我们重点研究了估算X染色体上所有SNP解释的方差的功能,并测试了剂量补偿假设。GCTA软件是一个多用途的工具,用于估计和划分具有大型GWAS数据集的复杂性状变异。 主页: http://cnsgenomics.com/software/gcta/#概述 相关软件: PLINK公司;R(右);生物导体;MCMCglmm公司;ggplot2;塔塞尔;MASTOR公司;FFBSKAT公司;lme4公司;pi质量;KEGG公司;化学斑点;完整的;生物网格;顶帽;WGCNA公司;记录仪;边缘R;基因组特征;rTASSEL公司 引用于: 24文件 全部的 前5名86位作者引用 4 刘,金 2 安娜·邦内 2 范,周 2 杨,肯 2 赵冰新 2 邹飞 1 克里斯托弗·阿莫斯一世。 1 Bailey-Wilson,Joan E。 1 蔡明轩 1 陈伟 1 邱志扬 1 伊维特·康利(Yvette P.Conley)。 1 理查德·库克。 1 安德鲁·克罗塞特 1 安德鲁·达尔 1 戴明伟 1 塞西莉亚·道 1 格雷戈里·达内尔 1 阿尔贝托·桑托斯·德尔加多 1 伯尼·德夫林 1 巴巴拉·恩格哈特(Barbara E.Engelhardt)。 1 范汝宗 1 高勇 1 斯蒂芬·拉蒙·加西亚 1 伊丽莎白·加斯亚特 1 史蒂文·加泽尔 1 艾曼纽尔·盖宁 1 斯托扬·乔治耶夫 1 戈兰,大卫 1 Gong,Gail(盖尔·龚) 1 迈克尔·戈林。 1 关永涛 1 克里斯托弗·海曼 1 约翰娜·哈丁。 1 谢志林 1 胡燕玲 1 黄、健 1 黄元杰 1 蒋继明 1 蒋英达 1 蒋永华 1 焦玉玲 1 约翰斯通、伊恩·默里 1 乔纳森·基思(Jonathan M.Keith)。 1 兰贝特斯·克莱 1 孔裕芳 1 M'Hamed Lajmi,Lakhal-Chaieb 1 Lee,Ann B。 1 安妮·路易斯·卢特内格 1 莱维·莱德,塞林 1 李伟东 1 林华珍 1 刘伟 1 弗朗西斯·J·麦克马洪。 1 明、景思 1 莫,曾南 1 赛扬·穆克吉 1 英格丽德·奥克利·吉尔文 1 德巴希斯·保罗 1 彭亨 1 凯瑟琳·罗德 1 大卫·R·斯坦索尔茨。 1 孙磊 1 孙毅 1 曾俊英 1 Van Den Berg,David J。 1 安娜·I·巴斯克斯。 1 路易丝·冯·斯特肖 1 肯尼斯·威尔科克斯·瓦希特 1 王冷阳 1 王伟 1 王志超 1 周,Daniel E。 1 爱丽丝·惠特莫尔。 1 亚历山大·威尔逊。 1 夏、应村 1 熊、莫妙 1 袁、敖 1 张腾 1 赵宏宇 1 郑树荣 1 钟晓刚 1 周青鸟 1 周,权 1 朱洪图 1 邹一鸣 全部的 前5名15连载 三 美国统计协会杂志 三 电子统计杂志 2 统计年鉴 2 生物计量学 2 中国统计学 2 应用统计学年鉴 2 分子生物学方法 1 加拿大统计杂志 1 统计规划与推断杂志 1 理论种群生物学 1 机器学习研究杂志 1 遗传学和分子生物学中的统计应用 1 计算与图形统计杂志 1 理论生物学杂志 1 贝叶斯分析 在5个字段中引用 21 统计学(62-XX) 8 生物学和其他自然科学(92-XX) 三 概率论与随机过程(60-XX) 2 线性代数和多线性代数;矩阵理论(15-XX) 1 总体主题;集合(00-XX) 按年份列出的引文