生物网格

BioGRID:交互数据集的通用存储库。获取蛋白质和遗传相互作用的统一数据集对于基因/蛋白质功能的询问和全球网络特性的分析至关重要。BioGRID是一个可自由访问的物理和遗传相互作用数据库,可从http://www.thebiogrid.org获得。BioGRID版本2.0包括来自酿酒酵母、秀丽隐杆线虫、黑腹果蝇和智人的超过116000个相互作用。通过对酿酒酵母的原始文献进行详尽的整理,最近从5778个来源添加了超过30000个相互作用。内部超链接的web界面允许快速搜索和检索交互数据。完整或用户定义的数据集可以作为制表符分隔的文本文件和PSI-MI XML免费下载。预先计算的交互图形布局有多种文件格式。用户定制的嵌入蛋白质、基因和相互作用属性的图形可以通过一个叫做鱼鹰的可视化系统来构建,该系统可以动态链接到生物网格上。


zbMATH参考文献(46篇文章引用)

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按年份排序(引用)
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