托法特

TopAt2:在插入、缺失和基因融合的存在下转录组的精确排列。ToPHAT是一种用于RNA序列(RNA Seq)实验的流行拼接对准器。在本文中,我们描述了ToPHAT2,它包含了许多显著增强ToPAT。ToPHAT2可以对齐由最新测序技术产生的各种长度的读数,同时允许相对于参考基因组可变长度的吲哚。除了从头拼接对齐,ToPHAT2可以对齐阅读跨越融合断裂,这可能发生在基因组易位。ToPHAT2结合了识别新剪接位点的能力,并将其直接映射到已知转录本,产生敏感和精确的比对,即使对于高度重复基因组也存在假基因。ToPHAT2可在HTTP:/ccCJB.JU.EdU/Studio/ToPHAT中使用。


ZBMaCT中的参考文献(20篇文章中引用)

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