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格瓦斯卡特

在EMBL-EBI GWAS目录中表示和建模数据


生物导体版本:释放(3.19)

在EMBL-EBI GWAS目录中表示和建模数据。

作者:VJ Carey在channing.harvard.edu>

维护人员:VJ Carey在channing.harvard.edu>

引文(从R中输入引文(“gwascat”))以下为:

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“gwascat”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“gwascat”)
gwascat—EBI目录中GWAS点击量的G范围 HTML格式 R脚本
gwascat:构建和查询NHGRI GWAS目录 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 遗传学,软件
版本 2.36.0
在生物导体中 生物C 2.10(R-2.15)(12年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=3.5.0),方法
进口 S4载体(>= 0.9.25),I范围,基因组信息Db,基因组学范围(>= 1.29.6),基因组特征,阅读器,生物串,注释Dbi,生物文件缓存,snpStats(snpStat),变量注释,批注中心
系统要求
统一资源定位地址
查看更多
建议 出生日期.db,数据传输时间,针织者,RBGL公司,测试那个,rmarkdown公司,数字播放器,Gviz公司,Rsamtools软件,rtracklayer公司,图表,ggbio公司,DelayedArray(延迟阵列),TxDb(发送日期)。Hsapiens。UCSC.hg19.known基因,组织Hs.eg.db,仿生风格
链接到
增强功能 SNPlocs公司。Hsapiens.dbSNP144.GRCh37型
取决于我 vtpnet(vtpnet),提升(liftOver)
导入我 循环RNA分析器
建议我 基因组得分,hmdb查询,ld块,帕格尔姆,TFutils(TFutils),抓地力2db
指向我的链接
生成报告 生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 格瓦斯卡特_2.36.0.tar.gz
Windows二进制 gwascat_2.36.0.zip文件
macOS二进制(x86_64) 格瓦萨特2.36.0.tgz
macOS二进制(arm64) 格瓦萨特2.36.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gwascat网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/gwascat
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/gwascat网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/gwascat网站/
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