循环RNA分析器
circRNAprofiler：一种基于R的环状RNA下游分析计算框架
生物导体版本：释放（3.18）
基于R的计算框架，用于对circRNAs进行全面的电子分析。该计算框架允许组合和分析先前由多种公开可用的基于注释的circRNA检测工具检测到的circRNA。它涵盖了circRNAs分析的不同方面，从差异表达分析、进化保护、生物发生到功能分析。
作者：西蒙娜·奥菲罗
维护人员：西蒙娜·奥菲罗（Simona Aufero）
引文（从R中输入引文（“circRNAprofiler”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.3”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“circRNAprofiler”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览渐晕图（“circRNAprofiler”）
细节
| 生物视图 |
注释,差异表达式,功能预测,基因预测,基因组组装,软件,结构预测 |
| 版本 |
1.16.0 |
| 在生物导体中 |
生物技术3.10（R-3.6）（4.5年） |
| 许可证 |
GPL-3公司 |
| 取决于 |
R（>=4.3.0） |
| 进口 |
dplyr、magrittr、readr、，rtracklayer公司、stringr、stringi、，DESeq2公司,边缘R,基因组学范围,I范围、seqinr、R.utils、reformate2、ggplot2、utils、rlang、，S4载体，统计，基因组信息Db,普世运动,批注Hub,BS基因组。哈皮恩斯。加州大学圣保罗分校hg19,生物串,格瓦斯卡特,牛基因组 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/Aufero/circRNAprofiler（https://github.com/Aufero） |
| 错误报告 |
https://github.com/Aufero/circRNAprofiler/issues |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
