RBSURFpred公司 swMATH ID: 35359 软件作者： 苏米特·塔拉福德；马里兰州托基尔·艾哈迈德。；伊克巴尔，苏梅亚；马里兰州Tamjidul Hoque；Sohel Rahman，M。 描述： RBSURFpred：使用正则化和优化回归在实空间和二进制空间中建模蛋白质可访问表面积。蛋白质残基的可及表面积（ASA）是蛋白质结构预测、结合区域识别、折叠识别等问题的有效特征。通过有效特征变量的应用改进ASA的预测是一项具有挑战性但值得探索的任务，尤其是在机器学习领域。在现有的ASA预测因子中，REGAd（^3）p是一种高度准确的ASA预测器，它基于带3次多项式核的正则化精确回归。在这项工作中，我们提出了一个新的预测因子RBSURFpred，它通过Chou的通用PseAAC将58个物理化学、进化和结构特性整合到9元组肽中，从而在多个维度上扩展了REGAd（^3）p，使我们能够在预测实际值和二进制ASA时获得更高的精确度。我们将RBSURFpred用于实空间和二进制空间预测与最先进的预测工具（如REGAd（^3）p和SPIDER2）进行了比较。我们还对RBSURFpred在不同氨基酸及其特性方面的性能进行了严格的分析，并进行了生物学相关的案例研究。RBSURFpred的性能为社区建立了一个有用的工具。 主页： https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0022519317305763 关键词： 可及表面积;PSEE公司;蛋白质结构;相对可溶性;元启发式 相关软件： NETASA公司;在D-CRF上;哼-mPLoc;欧盟-mPLoc;iRSpot-EL接口;iRNA-PseColl基因;pLoc-mEuk公司;国际RNA-AI;iSNO-AAP航空公司;iSNO心理交流;iRSpot-PseDNC公司;iLoc-Hum公司;iPPBS-光学;iAMP-2L型;国际RSpot-TNCPseAAC;iPro54-PseKNC;已被淘汰;DNA紊乱;ElemStatLearn（电子状态学习） 引用于： 1文件 标准条款 1出版物描述软件，包括1出版物以zbMATH为单位 年份 RBSURFpred：使用正则化和优化回归在实空间和二进制空间中建模蛋白质可访问表面积。 Zbl 1397.92542号苏米特·塔拉福德;马里兰州图基尔·艾哈迈德。;苏梅亚伊克巴尔;马里兰州Tamjidul Hoque;Sohel Rahman，M。 2018 5位作者引用 1 塔姆吉杜尔·霍克 1 苏梅亚伊克巴尔 1 拉赫曼，穆罕默德·苏赫尔 1 苏米特·塔拉福德 1 马里兰州托基尔·艾哈迈德。 连载1篇 1 理论生物学杂志 在2个字段中引用 1 统计学（62-XX） 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文