埃尔斯波特

iRSpot EL:用集成学习方法识别重组点。动机:减数分裂和重组共存于DNA系统中,是细胞繁殖和生长不可缺少的两个方面。在后基因组时代,随着基因组序列的雪崩,获得DNA重组位点的信息是一个迫切的挑战,因为它可以及时地为减数分裂重组的机制和基因组进化过程提供非常有用的信息。结果:为了解决这一挑战,我们开发了一个预测因子IRSPOT-EL:,它将伪K-元组核苷酸组成的不同模式和基于二核苷酸的自互协方差模式融合到聚类方法的集成分类器中。对一个广泛使用的基准数据集进行的五倍交叉测试表明,新的预测值显著优于现有的预测值。特别是,新的预测因子远远超出了他们的能力范围,可以很容易地用于全基因组分析,所得结果与实验图谱非常一致。可用性和实现:为了方便大多数实验科学家,在http://bioinformatics.hitsz.edu.cn/iRSpot-EL/上建立了一个用户友好的iRSpot-EL服务器,用户无需通过复杂的数学方程就可以轻松地获得所需的结果


zbMATH参考文献(引用于 29篇文章

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  1. 基于Hayqsad的多组分选择法:基于HayPsead的多组分选择法(2019年,基于HayPsead的蛋白质分类法:基于HayPsoD的多组分)
  2. Ghosh,Avirup;Yan,Hong:与非小细胞肺癌相关的EGFR-ErbB3异二聚体的氢键分析和耐药性(2019年)
  3. Hussain,Waqar;Khan,Yaser Daanial;Rasool,Nouman;Khan,Sher Afzal;Chou,Kuo Chen:Sprenlc PseAAC:通过Chou的5步规则和通用PseAAC开发的序列模型,用于识别蛋白质中的s-prenylization位点(2019年)
  4. 贾建华;李晓燕;邱,王仁;肖,宣;周,郭晨:iPPI PseAAC(CGR):通过将混沌博弈表示纳入PseAAC(2019年),识别蛋白质相互作用
  5. Khan,Yaser Daanial;Jamil,Mehreen;Hussain,Waqar;Rasool,Nouman;Khan,Sher Afzal;Chou,Kuo Chen:PSBOND PseAAC:通过PseAAC和统计矩积分预测二硫键合位点(2019年)
  6. 吕福华;朱茂树;林英英;钟宏斌;蔡磊;何,林;周国臣:CTLA-4-ig治疗狼疮性肾炎的初步疗效评价(2019年)
  7. 潘奕;王世元;张琦;陆倩子;苏东青;左永春;杨磊:周氏各种伪成分和还原氨基酸组成对动物毒素的分析与预测(2019)
  8. Tahir,Muhammad;Tayara,Hilal;Chong,Kil-To:iRNA-PseKNC(2methyl):通过卷积神经网络和Chou的伪成分识别RNA 2'-O-甲基化位点(2019年)
  9. 田宝光;吴,薛;陈,程;邱文英;马,秦;余,斌:融合周氏伪成分,利用小波去噪方法预测蛋白质-蛋白质相互作用(2019)
  10. Wang,Lidong;Zhang,Ruijun;Mu,Yashuang:Fu-SulfPred:通过Chou'S general PseAAC确定蛋白质S-硫基化位点(2019年)
  11. 阎元廷;吴曾宝;杜秀全;陈杰;赵,舒;张燕萍:非平衡数据过采样的三向决策集成方法(2019)
  12. 赵晓伟;张晓伟;张,叶;宁,乔;张宏瑞;纪金超;尹明浩:用粒子群优化的极值梯度提升系统识别N(^6)-甲基腺苷位点(2019)
  13. Arif,Muhammad;Hayat,Maqsood;Jan,Zahoor:IMem-2LSAAC:通过将SAAC的概念扩展到Chou的伪氨基酸组成中来识别膜蛋白及其类型的两级模型(2018年)
  14. Cheng,Xiang;Xiao,Xuan;Chou,Kuo Chen:pLoc峈bal-mGneg:通过准平衡训练数据集和通用PseAAC预测革兰氏阴性细菌蛋白质的亚细胞定位(2018)
  15. Chiu,Jimmy Ka Ho;Dillon,Tharam S.;Chen,Yi Ping Phoebe:RNA家族中的大规模频繁茎模式挖掘(2018)
  16. 贾仓智;杨青;邹权:基于通用PseKNC的四种不同模式预测物种特异性基因组核小体定位(2018)
  17. Ju,Zhe;Wang,Shi Yun:基于mRMR特征选择和模糊支持向量机算法的S-磺基化位点预测(2018)
  18. 梁云云;张胜利:通过Kullback-Leibler Difference将不同模式的PSSM整合到周氏通用PseAAC中,识别革兰氏阴性细菌分泌的蛋白质类型(2018)
  19. 梅,娟;付,易;赵,季:用特征选择和周的一般伪氨基酸组成分析和预测离子通道抑制剂(2018)
  20. 邱文英;李文英;李珊珊;崔晓雯;俞昭敏;王明辉;杜俊伟;彭彦军;俞斌:通过将伪位置特异性评分矩阵纳入周氏伪氨基酸组成预测蛋白质亚软骨位置(2018)