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iRSpot-EL接口

swMATH ID: 24776
软件作者: 刘,B。;王,S。;朗·R。;周,K.-C。
描述: iRSpot-EL:使用集成学习方法识别重组点。动机:减数分裂和重组共存于DNA系统中,是细胞繁殖和生长不可或缺的两个方面。随着后基因组时代出现的基因组序列雪崩,获取DNA重组点的信息是一个紧迫的挑战,因为它可以及时地为减数分裂重组机制和基因组进化过程提供非常有用的见解。结果:为了应对这一挑战,我们开发了一个预测因子,称为IRSPOT-EL:,将不同模式的伪K元组核苷酸组成和基于二核苷酸的自交叉协方差模式融合到聚类方法的集成分类器中。对一个广泛使用的基准数据集进行的五倍交叉测试表明,新的预测因子显著优于现有的预测因子。特别是,在他们力所能及的范围之外,新的预测因子可以很容易地用于进行全基因组分析,所得结果与实验图非常一致。可用性和实现:为了方便大多数实验科学家,已在http://bioinformatics.hitsz.edu.cn/iRSpot-EL/用户无需通过复杂的数学方程即可轻松获得所需结果
主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27531102
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5 周国琛
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1 邹全(音)
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