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pLoc-mEuk:通过将关键GO信息提取到通用PseAAC中,预测多标记真核蛋白质的亚细胞定位。在预测真核蛋白质的亚细胞定位方面已经做了很多努力,但现有的方法大多有以下两个局限性:(1)它们的覆盖范围小于10个位置,因此无法覆盖真核细胞中的许多细胞器;(2)它们只能用于处理单个标记系统,其中每个组成蛋白质只有一个位置。实际上,具有多个位置的蛋白质特别有趣,因为它们可能具有一些特殊的功能,对于深入了解细胞内的生物过程以及选择药物靶点非常重要。虽然有几种预测因子(如“Euk-mPLoc”、“Euk-PLoc 2.0”和“iLoc-Euk”)可以覆盖多达22个不同的定位位点,并且它们还具有处理多标记蛋白质的功能,但仍需进一步努力提高其预测质量,特别是在提高绝对正确率和降低绝对错误率方面。在这里,我们提出了一种新的预测因子“plocmeuk”,它将关键的GO(基因本体)信息提取到通用PseAAC(伪氨基酸组成)中。在一个高质量和严格的基准数据集上进行的严格交叉验证表明,所提出的pLoc-mEuk预测因子显著优于上述三个预测因子中最好的iLoc-Euk。为了最大限度地方便大多数实验科学家,我们在http://www.jci-bioinfo.cn/pLoc-mEuk/,用户无需进行复杂的数学运算,就可以很容易地得到他们想要的结果。


zbMATH中的参考文献(参考文献30篇文章)

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按年份排序(引用)
  1. 阿迪丽娜,谢赫;法里德,德万医学博士;Shatabda,Swakkhar:通过周的通用PseAAC使用关键特征预测有效的DNA结合蛋白(2019)
  2. 艾哈迈德,贾迈勒;Hayat,Maqsood:MFSC:采用Chou's PseAAC成分的一般形式对高尔基蛋白进行分类的基于多投票的特征选择(2019年)
  3. 白、小鹿;陈晓林:Bac2A抗菌肽的合理设计、构象分析和膜渗透动力学研究(2019年)
  4. 侯赛因,瓦卡尔;汗,亚瑟·达尼尔;拉苏尔,努曼;可汗,谢尔·阿夫扎尔;周国琛:Sprenlc PseAAC:基于序列的模型,通过Chou的5步规则和通用PseAAC来识别蛋白质中的s-prenylization位点(2019年)
  5. 贾建华;李小燕;邱,王仁;晓萱;周国臣:iPPI PseAAC(CGR):通过将混沌博弈表示纳入PseAAC(2019年),识别蛋白质-蛋白质相互作用
  6. 汗,亚瑟·达尼尔;雅米勒,米伦;侯赛因,瓦卡尔;拉苏尔,努曼;可汗,谢尔·阿夫扎尔;周国琛:psbond-PseAAC:利用PseAAC和统计矩积分预测二硫键位点(2019)
  7. 吕福华;朱茂树;林英;钟宏斌;蔡磊;他,林;周国臣:CTLA-4-ig治疗狼疮性肾炎的初步疗效评估(2019年)
  8. 潘毅;王世元;张琪;陆谦子;苏东青;左永春;杨磊:周氏不同伪成分和还原氨基酸组成对动物毒素的分析与预测(2019)
  9. 路特,亚灰树;Mahapatra,Rajani Kanta:\textITi恶性疟原虫CDPK5蛋白的分子建模、对接和动力学分析(2019年)
  10. 沈,沂南;唐继军;郭飞:结合进化和理化信息识别蛋白质亚细胞定位(2019)
  11. 塔希尔,穆罕默德;塔亚拉,希拉;Chong,Kil-To:iRNA-PseKNC(2甲基):通过卷积神经网络和Chou的伪成分识别RNA 2'-O-甲基化位点(2019年)
  12. 田宝光;吴雪;陈,程;邱文英;马、秦;于斌:融合不同的周氏伪成分并使用小波去噪方法预测蛋白质-蛋白质相互作用(2019)
  13. 王立东;张瑞军;Mu,Yashuang:Fu-SulfPred:通过Chou'S general PseAAC确定蛋白质S-硫基化位点(2019)
  14. 赵小伟;张,叶;宁,乔;张宏瑞;季金超;Yin,Minghao:使用粒子群优化优化的极端梯度提升系统识别N(^6)-甲基腺苷位点(2019)
  15. 阿克巴,沙希德;Hayat,Maqsood:二甲基STTNC:通过将SAAC的概念扩展到Chou的PseAAC中以形成RNA序列来识别N(^6)-甲基腺苷位点(2018)
  16. 阿里夫,穆罕默德;哈亚特,马苏德;Jan,Zahoor:IMem-2LSAAC:通过将SAAC的概念扩展到Chou的伪氨基酸组成来区分膜蛋白及其类型的两级模型(2018)
  17. 赵家豪;泰伦。;陈一平:RNA家族中大规模频繁茎模式挖掘(2018)
  18. 贾、仓植;杨青;邹全:NucPosPred:general PseKNC的四种不同模式预测物种特异性基因组核小体定位(2018)
  19. 居哲;王士云:基于mRMR特征选择和模糊支持向量机算法的S-磺基化位点预测(2018)
  20. Kanatchikov,Igor V.:量子Yang-Mills理论中的薛定谔波泛函(2018)