伊尔纳PseColl

iRNA PseColl:通过结合核苷酸的集体效应来识别不同RNA修饰的发生部位。有许多不同类型的RNA修饰,这是许多生物过程所必需的。了解RNA修饰在其序列中的发生部位是深入了解其生物学功能和机制的关键。不幸的是,仅仅通过实验来确定这些位点既费时又费力。虽然在这方面发展了一些计算方法,但每一种方法都只能单独处理某些类型的修改。据我们所知,到目前为止,还没有一种方法能够用一个无缝的软件包或平台来识别几种不同类型RNA修饰的发生位点。为了应对这一挑战,开发了一个名为“iRNA PseColl”的新平台。它是通过其组成核苷酸的化学物理性质和密度分布,将序列元素的个体和集体特征结合到RNA的一般伪K-元组核苷酸组成(PseKNC)中而形成的。严格的交叉验证表明,拟议平台实现的预期成功率相当高。为了最大限度地方便大多数实验生物学家,该平台的web服务器已经在http://lin.uestc.edu.cn/server/iRNA-PseColl以及一个循序渐进的用户指南,这将允许用户轻松地获得他们想要的结果,而不需要经过本文中涉及的数学细节。


zbMATH中的参考文献(参考文献31条)

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按年份排序(引用)
  1. 艾哈迈德,贾迈勒;Hayat,Maqsood:MFSC:采用Chou's PseAAC成分的一般形式对高尔基蛋白进行分类的基于多投票的特征选择(2019年)
  2. 陈国栋;曹操,伙计;俞佳琳;郭新云;施少平:周氏通用PseAAC结合六种特征对原核生物赖氨酸乙酰化位点的预测与功能分析(2019)
  3. 侯赛因,瓦卡尔;汗,亚瑟·达尼尔;拉苏尔,努曼;可汗,谢尔·阿夫扎尔;周国琛:Sprenlc PseAAC:基于序列的模型,通过Chou的5步规则和通用PseAAC来识别蛋白质中的s-prenylization位点(2019年)
  4. 贾建华;李小燕;邱,王仁;晓萱;周国臣:iPPI PseAAC(CGR):通过将混沌博弈表示纳入PseAAC(2019年),识别蛋白质-蛋白质相互作用
  5. 汗,亚瑟·达尼尔;雅米勒,米伦;侯赛因,瓦卡尔;拉苏尔,努曼;可汗,谢尔·阿夫扎尔;周国琛:psbond-PseAAC:利用PseAAC和统计矩积分预测二硫键位点(2019)
  6. 吕福华;朱茂树;林英;钟宏斌;蔡磊;他,林;周国臣:CTLA-4-ig治疗狼疮性肾炎的初步疗效评估(2019年)
  7. 宁,乔;马志强;赵晓伟:Dforml(KNN)-PseAAC:通过周的5步规则和伪成分使用K-最近邻算法检测蛋白质序列中的甲酰化位点(2019)
  8. 潘毅;王世元;张琪;陆谦子;苏东青;左永春;杨磊:周氏不同伪成分和还原氨基酸组成对动物毒素的分析与预测(2019)
  9. 路特,亚灰树;Mahapatra,Rajani Kanta:\textITi恶性疟原虫CDPK5蛋白的分子建模、对接和动力学分析(2019年)
  10. 孙平平;陈永兵;刘波;高、彦欣;韩,叶;何飞;Ji,Jin Chao:DeepMRMP:使用深度学习对多种RNA修饰位点的新预测因子(2019)
  11. 塔希尔,穆罕默德;塔亚拉,希拉;Chong,Kil-To:iRNA-PseKNC(2甲基):通过卷积神经网络和Chou的伪成分识别RNA 2'-O-甲基化位点(2019年)
  12. 田宝光;吴雪;陈,程;邱文英;马、秦;于斌:融合不同的周氏伪成分并使用小波去噪方法预测蛋白质-蛋白质相互作用(2019)
  13. 王立东;张瑞军;Mu,Yashuang:Fu-SulfPred:通过Chou'S general PseAAC确定蛋白质S-硫基化位点(2019)
  14. 赵小伟;张,叶;宁,乔;张宏瑞;季金超;Yin,Minghao:使用粒子群优化优化的极端梯度提升系统识别N(^6)-甲基腺苷位点(2019)
  15. 阿克巴,沙希德;Hayat,Maqsood:二甲基STTNC:通过将SAAC的概念扩展到Chou的PseAAC中以形成RNA序列来识别N(^6)-甲基腺苷位点(2018)
  16. 程、香;晓萱;Chou,Kuo Chen:pLoc逯bal-mGneg:通过准平衡训练数据集和通用PseAAC预测革兰氏阴性细菌蛋白质的亚细胞定位(2018)
  17. 赵家豪;狄龙,塔拉姆S。;陈一平:RNA家族中大规模频繁茎模式挖掘(2018)
  18. 贾、仓植;杨青;2018年几种不同的核仁定位模式(OSP-Zou-2018)
  19. 居哲;王士云:基于mRMR特征选择和模糊支持向量机算法的S-磺基化位点预测(2018)
  20. 梁云云;张胜利:通过Kullback-Leibler Difference将不同模式的PSSM整合到周氏的通用PseAAC中,识别革兰氏阴性细菌分泌的蛋白质类型(2018)