嗯mPLoc

Hum-mPLoc:一种用于大规模人类蛋白质亚细胞定位预测的集成分类器。蛋白质可能同时存在于两个或多个不同的亚细胞位置,或在两个或多个不同的亚细胞位置之间移动。这种具有多个位置或动态特征的蛋白质特别有趣,因为它们可能具有一些非常特殊的生物学功能,这对基础研究和药物发现的研究者都很感兴趣。例如,在瑞士Prot数据库(版本50.7,发布于2006年9月19日)中的6408个人类蛋白质条目中,有973个(约15%)具有多个定位点。同一个数据库中的人类蛋白质条目的总数(除了那些用“片段”注释的或那些少于50个氨基酸的条目)是14370个,这意味着(14370-6408)=7962个条目没有关于它们的亚细胞位置的知识。虽然我们可以使用计算方法来预测缺口所需的信息,但是到目前为止,所有现有的预测人类蛋白质亚细胞定位的方法都局限于单个位点的情况。为了克服这一障碍,我们开发了一种新的集成分类器Hum-mPLoc,它可以用来处理多个位置站点的情况。Hum mPLoc可以作为web服务器免费访问,网址是http://202.120.37.186/bioinf/Hum-multi。同时,为了方便相关领域的工作人员,Hum-mPLoc被用于识别瑞士Prot数据库中没有亚细胞位置注释或注释为不确定的所有人类蛋白质条目。由此获得的大规模结果已存放在一个可下载的文件中,文件名为“Tab_Hum-mPLoc.xls”。该文件可在同一网站上获得,每年更新两次,以包括人类蛋白质的新条目,并反映出Hum-mPLoc的持续发展。


zbMATH参考文献(参考 23篇文章

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按年份排序(引文)
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  18. Brown,J.B.;Akutsu,Tatsuya:通过一级序列、二级结构和同源性鉴定新的DNA修复蛋白(2009年)ioport公司
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