伊尔纳艾伊

iRNA-AI:识别RNA序列中腺苷到肌苷的编辑位点。在腺苷脱氨酶(ADAR)的催化下,RNA中的腺苷到肌苷(A-to-I)编辑不仅涉及到许多重要的生物学过程,而且与一系列重大疾病密切相关。因此,了解RNA中A-to-I编辑位点对基础研究和药物开发都至关重要。给定一个含有许多腺苷(A)残基的非特征RNA序列,我们能确定其中哪一个可以进行A-to-I编辑,而哪一个不能?不幸的是,到目前为止,还没有一种计算方法可以单独基于RNA序列信息来解决这样一个重要的问题。我们提出了一种将核苷酸序列中的空碱基和碱基的分布结合起来的伪核苷酸序列。通过严格的刀切检验和独立数据集检验表明,所提出的预报器具有很好的应用前景。iruena是一个非常方便的用户通过iruna/air.com/web/eduna.com建立的一个方便用户获取实验结果的服务器。


zbMATH参考文献(参考 26篇文章 引用)

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按年份排序(引用)
  1. Ahmad,Jamal;Hayat,Maqsood:MFSC:采用Chou's PseAAC成分的一般形式对高尔基蛋白进行分类的基于多投票的特征选择(2019年)
  2. Hussain,Waqar;Khan,Yaser Daanial;Rasool,Nouman;Khan,Sher Afzal;Chou,Kuo Chen:Sprenlc PseAAC:通过Chou的5步规则和通用PseAAC开发的序列模型,用于识别蛋白质中的s-prenylization位点(2019年)
  3. 贾建华;李晓燕;邱,王仁;肖,宣;周,郭晨:iPPI PseAAC(CGR):通过将混沌博弈表示纳入PseAAC(2019年),识别蛋白质相互作用
  4. Khan,Yaser Daanial;Jamil,Mehreen;Hussain,Waqar;Rasool,Nouman;Khan,Sher Afzal;Chou,Kuo Chen:PSBOND PseAAC:通过PseAAC和统计矩积分预测二硫键合位点(2019年)
  5. 吕福华;朱茂树;林英英;钟宏斌;蔡磊;何,林;周国臣:CTLA-4-ig治疗狼疮性肾炎的初步疗效评价(2019年)
  6. 宁,乔;马志强;赵晓伟:Dforml(KNN)-PseAAC:通过周的5步规则和伪成分,使用K近邻算法检测蛋白质序列中的甲酰化位点(2019)
  7. 潘奕;王世元;张琦;陆倩子;苏东青;左永春;杨磊:周氏各种伪成分和还原氨基酸组成对动物毒素的分析与预测(2019)
  8. Rout,Subhashree;Mahapatra,Rajani Kanta:\textITi恶性疟原虫CDPK5蛋白的分子建模、对接和动力学分析(2019年)
  9. 赵晓伟;张晓伟;张,叶;宁,乔;张宏瑞;纪金超;尹明浩:用粒子群优化的极值梯度提升系统识别N(^6)-甲基腺苷位点(2019)
  10. Arif,Muhammad;Hayat,Maqsood;Jan,Zahoor:IMem-2LSAAC:通过将SAAC的概念扩展到Chou的伪氨基酸组成中来识别膜蛋白及其类型的两级模型(2018年)
  11. Cheng,Xiang;Xiao,Xuan;Chou,Kuo Chen:pLoc峈bal-mGneg:通过准平衡训练数据集和通用PseAAC预测革兰氏阴性细菌蛋白质的亚细胞定位(2018)
  12. Chiu,Jimmy Ka Ho;Dillon,Tharam S.;Chen,Yi Ping Phoebe:RNA家族中的大规模频繁茎模式挖掘(2018)
  13. Contreras Torres,Ernesto:通过将蛋白质的全局和局部物理化学和构象特性纳入到general Chou的PseAAC中来预测蛋白质的结构类别(2018)
  14. 贾仓智;杨青;邹权:基于通用PseKNC的四种不同模式预测物种特异性基因组核小体定位(2018)
  15. 梁云云;张胜利:通过Kullback-Leibler Difference将不同模式的PSSM整合到周氏通用PseAAC中,识别革兰氏阴性细菌分泌的蛋白质类型(2018)
  16. 梅,娟;付,易;赵,季:用特征选择和周的一般伪氨基酸组成分析和预测离子通道抑制剂(2018)
  17. 邱文英;李文英;李珊珊;崔晓雯;俞昭敏;王明辉;杜俊伟;彭彦军;俞斌:通过将伪位置特异性评分矩阵纳入周氏伪氨基酸组成预测蛋白质亚软骨位置(2018)
  18. Sabooh,M.Fazli;Iqbal,Nadeem;Khan,Mukhtaj;Khan,穆斯林;Maqbool,H.F.:使用复合编码特征识别RNA序列中的5-甲基胞嘧啶位点到Chou的PseKNC中(2018年)
  19. Tarafder,Sumit;Toukir Ahmed,医学博士;Iqbal,Sumaiya;Tamjidul Hoque,医学博士;Sohel Rahman,M.:RBSURFpred:使用正则化和优化回归在实空间和二进制空间中建模蛋白质可及表面积(2018年)
  20. 张胜利;段欣:蛋白质亚细胞定位的过采样预测和周氏通用PseAAC(2018)