网络网关 swMATH ID: 21512 软件作者： Pariya Behrouzi，Ernst C.Wit 描述： netgwas：基于网络的全基因组关联研究的R包。图形模型为多变量数据中变量之间的复杂关系建模和进行统计推断提供了强大的工具。它们广泛用于统计和机器学习，尤其是分析生物网络。在本文中，我们介绍了R包netgwas，它是为实现遗传学中三个重要且相互关联的目标而设计的：连锁图构建、重建染色体内和染色体间的相互作用以及探索高维基因型-表型（和基因型-表现型-环境）网络。netgwas包能够处理任何倍性水平的物种。该软件包实现了在连锁图构建方面的最新改进（Behrouzi和Wit，2017b），以及在推断非高斯、离散和混合数据的条件独立网络方面（Behrouzi和Wit，2017a），特别是在基因型-表型数据集方面。该软件包使用多核处理器上的并行化策略来加速大型数据集的计算。此外，它还包含几个用于模拟和可视化的函数，以及三个来自文献的多元示例数据集，用于说明软件包的功能。本文简要概述了软件包中实施的统计方法。本文的主体部分解释了如何使用该软件包。此外，我们用实际示例说明了包的功能。 主页： https://cran.r-project.org/web/packages/netgwas/index.html 源代码： https://github.com/cran/netgwas网址 依赖项： R（右） 关键词： 应用;arXiv统计.AP;生物分子;arXiv q生物.BM;基因组学;arXiv q-bio.GN;分子网络;arXiv q-bio.MN;人口与进化;arXiv q-bio.PE公司;arXiv公司;墨迹图构建;连锁不平衡;上位;基因型-表型网络;基因型-表型-环境网络;无方向图形模型;高斯联结;R包 相关软件： 矩阵;R（右）;一幅地图;藤架;R/位点;记录仪;沃盖姆;ASMap（美国地图）;dlmap（dlmap）;Rbgl公司;质量（R）;地图制作者;ss曲线图;巨大的;bn学习;pcalg公司;玻璃制品;LAPACK公司;BDgraph（BDgraph） 引用于： 1文件 标准条款 1出版物描述软件 年份 netgwas：基于网络的全基因组关联研究的R包链接巴黎贝鲁齐；丹尼·阿伦兹（Danny Arends）；Ernst C.Wit先生。 2022 被5位作者引用 1 丁俊华 1 李奇斋 1 王金娟 1 薛元 1 张三国 连载1篇 1 统计学在遗传学和分子生物学中的应用 在2个字段中引用 1 统计学（62-XX） 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文