藤架 swMATH编号： 21513 软件作者： Grandke，F.、S.Ranganathan、N.van Bers、J.R.de Haan、D.Metzler 描述： R package Pergola：多倍体快速确定性连锁图谱。背景：农业和园艺上重要的植物物种中有很大一部分是多倍体。遗传图谱被育种家和遗传学家用来定位基因和性状之间的关联。标准工具不支持创建多倍体物种的连锁图。我们希望克服这一局限性，并通过仿真研究验证我们的结果。结果：我们开发了PERGOLA，一种解决这个问题的确定性和启发式方法。我们表明，它为模拟数据集和实际数据集创建了正确的链接组、标记顺序和距离。我们将其与现有工具进行了比较，并证明它克服了倍性的限制，在计算时间和映射精度方面优于它们。我们将连锁图表示为树状图，并表明这在不同图谱的比较中具有优势。结论：PERGOLA可以成功地用于计算二倍体和多倍体物种的连锁图谱，其性能优于现有工具。 主页： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5210299/ 依赖项： R（右） 相关软件： 一幅地图;卢比/夸脱;矩阵;R（右）;网络网关;wgaim公司;ASMap（美国地图）;dlmap（dlmap）;迁移率;质量（R）;Rbgl公司;地图制作者 引用于： 0个文档