pSuc-Lys公司 swMATH ID: 16643 软件作者： 贾建华；刘子；肖宣；刘炳祥；周国晨 描述： pSuc-Lys：使用PseAAC和集成随机森林方法预测蛋白质中的赖氨酸琥珀酰化位点。蛋白赖氨酸琥珀酰化是一种翻译后修饰（PTM），在调节多种生物过程中起着重要作用。然而，它也与一些疾病有关。因此，从基础研究和药物开发的角度来看，我们面临着一个具有挑战性的问题：对于一个含有许多Lys残基的非特征化蛋白质序列，哪些可以进行琥珀酰化，哪些不能？为了解决这个问题，我们开发了一个名为pSuc-Lys的预测器，方法是：（1）将序列耦合信息合并到一般的伪氨基酸组成中，（2）通过随机抽样平衡倾斜的训练数据集，以及（3）通过融合一系列单独的随机森林分类器构建集合预测器。严格的交叉验证表明，它显著优于现有方法。pSuc-Lys的用户友好的web服务器已在url上建立{http://www.jci-bioinfo.cn/pSuc-Lys}用户无需通过复杂的数学方程即可轻松获得所需的结果。我们注意到，这里提出的公式和方法也可以用于分析计算蛋白质组学中的许多其他问题。 主页： http://www.jci-bioinfo.cn/pSuc-Lys 关键词： 赖氨酸琥珀酰化;序列耦合模型;通用PseAAC;随机下采样;集合随机森林;pSuc-Lys web服务器 相关软件： 综合布线;iRNA-PseColl基因;iSuc-选择权;iPro54-PseKNC;iRSpot-EL接口;iPTM-mLys公司;iRSpot-PseDNC公司;pLoc-mEuk公司;pLoc-动物;国际RNA-AI;iPromoter-2L型;2L-piRNA;pLoc-工厂;i增强器-2L;普南-PC;iDNA6mA-PseKNC公司;iRNA-PseU基因;pLoc-mGneg公司;iRNAm5C-PseDNC;iRNA-3类型A 引用于： 31文件 更多出版物： http://www.jci-bioinfo.cn/pSuc-Lys/pSucLys_citation.html 标准文章 1出版物描述软件，包括1出版物以zbMATH为单位 年份 pSuc-Lys：使用PseAAC和集成随机森林方法预测蛋白质中的赖氨酸琥珀酰化位点。 Zbl 1343.92153号贾建华;刘，子;肖宣;刘冰翔;周国晨 2016 全部的 前5名90位作者引用 6 周国成 三 马苏德·海亚特 三 谢尔·阿夫扎尔·汗 三 肖宣 2 瓦卡尔侯赛因 2 贾建华 2 Khan，Yaser Daterial 2 宁，乔 2 努曼·拉苏尔 2 王世元 2 杨磊 2 赵晓伟 2 左永春 1 谢赫·阿迪利纳 1 贾马尔·艾哈迈德 1 赛义德·艾哈迈德 1 穆罕默德·阿里夫 1 贾苍志 1 陈晓文 1 程翔 1 Chong，Kil To村 1 蒂塔拉吉·达什 1 阿卜杜拉·德赞吉 1 杜普峰 1 马里兰州Dewan Farid 1 傅毅 1 他，林 1 纳迪姆·伊克巴尔 1 梅伦·贾米勒 1 Jan，扎胡尔 1 纪金超 1 贾苍志 1 焦、熊 1 焦亚森 1 朱哲 1 可汗，穆斯林 1 拉文德拉·库马尔 1 苏尼尔·普兰特·拉尔 1 李晓燕 1 梁云云 1 林，英 1 刘冰翔 1 刘，子 1 约斯万·洛佩兹 1 陆福华 1 陆千子 1 吕英丽 1 马志强 1 拉贾尼·坎塔·马哈帕特拉 1 马尼梅加莱，D。 1 梅，胡安 1 雅各布·迈克尔森 1 苏坎塔蒙达尔 1 穆亚双 1 穆图·克里希南，S。 1 Pai，Priyadarshini P。 1 潘毅 1 青、杨 1 邱、王仁 1 绍巴Ranganathan 1 Route、Subhashree 1 Ehsan Saghapour 1 E.Siva桑卡里 1 阿卜杜勒·萨塔尔 1 穆罕默德·塞哈蒂 1 阿洛克·夏尔马 1 斯瓦克哈尔沙塔布达 1 阿比希哈·斯利瓦斯塔瓦 1 苏东青 1 Ghazaleh Taherzadeh 1 李桃英 1 希拉·塔亚拉 1 田坤 1 津田达彦 1 王丽东 1 王世云 1 杨青（Yang，Qing） 1 Youu，Stephen Shing-Toung先生 1 尹明浩 1 张宏瑞 1 张琪 1 张瑞军 1 张胜利 1 张，叶 1 赵，季 1 赵欣 1 钟洪斌 1 周，孟 1 朱茂树 1 邹全（音） 2篇连载文章中引用 30 理论生物学杂志 1 数学生物科学 在5个字段中引用 31 生物学和其他自然科学（92-XX） 12 计算机科学（68至XX） 10 统计学（62-XX） 1 组合数学（05-XX） 1 运筹学、数学规划（90-XX） 按年份列出的引文