iRNA-3类型A swMATH ID: 27660 软件作者: Chen,W。;冯·P。;Yang,H。;丁,H。;Lin,H。;周,K.C 描述: iRNA-3typeA:识别RNA腺苷位点的三种修饰类型。RNA修饰是指核苷酸的化学基团增加或其局部结构改变。了解这些修饰的发生部位对于深入了解生物功能和机制以及治疗一些基因组疾病至关重要。随着后基因组时代产生的RNA序列雪崩,人们提出了许多计算方法来逐一识别各种类型的RNA修饰。然而,到目前为止,还没有开发出任何方法来同时识别几种不同类型的RNA修饰。为了应对这一挑战,我们开发了一个名为“iRNA-3typeA”的预测因子,通过该预测因子,我们可以同时确定RNA中以下三种最常见的修饰的发生位置:(1)N1-甲基腺苷(m1A),(2)N6-甲基腺苷,(3)腺苷-肌苷(a-To-I)。通过对智人和小家鼠转录组的RNA序列进行严格的交叉验证表明,强大的新预测因子取得的成功率相当高。为了方便广大实验科学家,iRNA-3typeA用户友好的网络服务器已在http://lin-group.cn/server/iRNA-3typeA/。预计iRNA-3typeA可能成为基因组分析的有用高通量工具。 主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5992483/ 相关软件: iRNA-PseColl基因;iDNA6mA-PseKNC公司;pLoc-mGneg公司;iPromoter-2L型;iRSpot-EL接口;pLoc-mEuk公司;pLoc-动物;pSuc-Lys基因;2L-piRNA;pLoc-mHum(位置-湿度);iRNA-PseU基因;iRNAm5C PseDNC公司;iRSpot-Pse6NC;iRO-3wPseKNC;pLoc-工厂;pLoc-m病毒;iEnhancer-2L型;iPTM-mLys公司;iRSpot-PseDNC公司;综合布线 引用于: 17文件 全部的 前5名60位作者引用 三 周国成 2 纪金超 2 肖宣 1 谢赫·阿迪利纳 1 贾马尔·艾哈迈德 1 陈,程 1 陈一平菲比 1 陈永兵 1 程翔 1 Chiu、Jimmy Ka Ho 1 崇基都 1 泰拉姆·辛格·狄龙 1 马里兰州Dewan Farid 1 傅毅 1 高彦欣 1 韩,叶 1 马苏德·海亚特 1 他,费 1 他,林 1 贾建华 1 朱哲 1 拉文德拉·库马尔 1 李晓燕 1 梁云云 1 林,英 1 刘波 1 陆福华 1 卢千子 1 马,秦 1 马尼梅加莱,D。 1 梅,胡安 1 穆亚双 1 宁,乔 1 潘毅 1 邱、王仁 1 邱文英 1 E.Siva桑卡里 1 Swakkhar Shatabda 1 阿比希哈·斯利瓦斯塔瓦 1 苏东青 1 孙平平 1 希拉·塔亚拉 1 田宝光 1 王丽东 1 王世元 1 王世云 1 吴雪 1 杨磊 1 尹明浩 1 于斌 1 张宏瑞 1 张琪 1 张瑞军 1 张胜利 1 张、叶 1 赵,季 1 赵小伟 1 钟洪斌 1 朱茂树 1 左永春 2篇连载文章中引用 16 理论生物学杂志 1 数学生物科学与工程 在4个字段中引用 17 生物学和其他自然科学(92-XX) 11 计算机科学(68至XX) 5 统计学(62-XX) 1 运筹学、数学规划(90-XX) 按年份列出的引文