pLoc mGneg公司

pLoc-mGneg:通过通用PseAAC进行深层基因本体学习,预测革兰氏阴性细菌蛋白质的亚细胞定位。蛋白质的亚细胞定位信息对于揭示其在生命的基本单位细胞中的生物学功能至关重要。随着后基因组时代蛋白质序列的大量涌现,人们迫切需要开发一种仅凭序列信息就能及时识别其亚细胞位置的计算工具。目前的研究主要集中在革兰氏阴性菌蛋白方面。虽然人们在蛋白质亚细胞预测方面做了大量的工作,但是这个问题还远没有得到解决。这是因为越来越多的证据表明许多革兰氏阴性细菌蛋白质存在于两个或两个以上的位置。不幸的是,大多数现有的方法只能用来处理单一位置的蛋白质。实际上,具有多个位置的蛋白质可能具有一些特殊的生物学功能,对基础研究和药物设计都很重要。在这项研究中,我们利用多标记理论,开发了一种新的预测因子pLoc-mGneg,它可以预测革兰氏阴性细菌蛋白质的亚细胞定位。在一个高质量的基准数据集上进行严格的交叉验证表明,所提出的预测值显著优于用于相同目的的最新预测值iLoc-Gneg。为了方便大多数实验科学家,我们在http://www.jci-bioinfo.cn/pLoc-mGneg/上建立了一个用户友好的网络服务器,用户无需进行复杂的数学运算,就可以轻松地得到他们想要的结果。


zbMATH参考文献(参考 23篇文章

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  1. Adilina,Sheikh;Farid,Dewan医学博士;Shatabda,Swakkhar:利用关键特征通过周的通用PseAAC预测有效的DNA结合蛋白(2019年)
  2. Ahmad,Jamal;Hayat,Maqsood:MFSC:采用Chou's PseAAC成分的一般形式对高尔基蛋白进行分类的基于多投票的特征选择(2019年)
  3. 白晓璐;陈晓林:针对脓毒症革兰阳性临床菌株的Bac2A抗菌肽的合理设计、构象分析和膜渗透动力学研究(2019)
  4. Butt,Ahmad Hassan;Rasool,Nouman;Khan,Yaser Daanial:通过将基于统计矩的特征纳入Chou的PseAAC(2019年),预测抗氧化蛋白质
  5. 陈晓娟(音译)的交互作用;Zhou Zuan,Zhou Zuan;Zhuao Zua;Zhuao Zua;Zhuao Zuo;Jiao Zua;Zhuao Zua;Zhuao Zua;Zhuao Zua;Zhou Zua;Zhuao Zhua;Zhou Zua;Zho
  6. Khan,Yaser Daanial;Jamil,Mehreen;Hussain,Waqar;Rasool,Nouman;Khan,Sher Afzal;Chou,Kuo Chen:PSBOND PseAAC:通过PseAAC和统计矩积分预测二硫键合位点(2019年)
  7. 吕福华;朱茂树;林英英;钟宏斌;蔡磊;何,林;周国臣:CTLA-4-ig治疗狼疮性肾炎的初步疗效评价(2019年)
  8. 潘奕;王世元;张琦;陆倩子;苏东青;左永春;杨磊:周氏各种伪成分和还原氨基酸组成对动物毒素的分析与预测(2019)
  9. 沈一楠;唐继军;郭飞:结合进化和理化信息识别蛋白质亚细胞定位(2019)
  10. Tahir,Muhammad;Tayara,Hilal;Chong,Kil-To:iRNA-PseKNC(2methyl):通过卷积神经网络和Chou的伪成分识别RNA 2'-O-甲基化位点(2019年)
  11. 田宝光;吴,薛;陈,程;邱文英;马,秦;余,斌:融合周氏伪成分,利用小波去噪方法预测蛋白质-蛋白质相互作用(2019)
  12. Wang,Lidong;Zhang,Ruijun;Mu,Yashuang:Fu-SulfPred:通过Chou'S general PseAAC确定蛋白质S-硫基化位点(2019年)
  13. 赵晓伟;张晓伟;张,叶;宁,乔;张宏瑞;纪金超;尹明浩:用粒子群优化的极值梯度提升系统识别N(^6)-甲基腺苷位点(2019)
  14. Arif,Muhammad;Hayat,Maqsood;Jan,Zahoor:IMem-2LSAAC:通过将SAAC的概念扩展到Chou的伪氨基酸组成中来识别膜蛋白及其类型的两级模型(2018年)
  15. Cheng,Xiang;Xiao,Xuan;Chou,Kuo Chen:pLoc峈bal-mGneg:通过准平衡训练数据集和通用PseAAC预测革兰氏阴性细菌蛋白质的亚细胞定位(2018)
  16. Chiu,Jimmy Ka Ho;Dillon,Tharam S.;Chen,Yi Ping Phoebe:RNA家族中的大规模频繁茎模式挖掘(2018)
  17. 梁云云;张胜利:通过Kullback-Leibler Difference将不同模式的PSSM整合到周氏通用PseAAC中,识别革兰氏阴性细菌分泌的蛋白质类型(2018)
  18. 梅,娟;付,易;赵,季:用特征选择和周的一般伪氨基酸组成分析和预测离子通道抑制剂(2018)
  19. 邱文英;李文英;李珊珊;崔晓雯;俞昭敏;王明辉;杜俊伟;彭彦军;俞斌:通过将伪位置特异性评分矩阵纳入周氏伪氨基酸组成预测蛋白质亚软骨位置(2018)
  20. Sabooh,M.Fazli;Iqbal,Nadeem;Khan,Mukhtaj;Khan,穆斯林;Maqbool,H.F.:使用复合编码特征识别RNA序列中的5-甲基胞嘧啶位点到Chou的PseKNC中(2018年)