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生物
结晶学
第59卷
|
第4部分
国际标准编号:1399-0047
2003年4月发行
封面插图:
目前公认的B-DNA纤维模型结构使用球棒表示法显示,并用核苷酸着色,在连接P原子的主干上叠加一条带状物(
第620页
).
社论
《水晶学报》。
(2003年)。
D类
59
,
619
doi:10.1107/S0907444903005900
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DNA及其他
E.N.贝克
和
Z.道特
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《水晶学报》。
(2003年)。
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59
,
620-626
doi:10.1107/S0907444903003251
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从A到Z的DNA结构词汇表
A.戈什
和
M.班萨尔
这篇综述提供了目前已确定的DNA结构的词汇表,并概述了在Watson和Crick最初发现DNA结构50年后对DNA结构的当前理解。
它还强调了在给新的DNA多晶型命名时需要谨慎。
阅读文章
研究论文
《水晶学报》。
(2003年)。
D类
59
,
627-636
doi:10.1107/S0907444903001227
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一个木聚糖酶家族11的特征
枯草芽孢杆菌
B230用于纸张漂白
A.J.奥克利
,
T.海因里希
,
C.A.汤普森
和
M.C.J.威尔斯
耐热木聚糖酶家族11的结构
枯草杆菌
介绍了B230亚种,并对其结构进行了分析。
提出了提高这种酶热稳定性的可能方法。
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《水晶学报》。
(2003年)。
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59
,
637-643
doi:10.1010/S0907444903001938
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Cel7D的催化模块
黄孢原毛平革菌
作为手性选择剂:其与β受体阻滞剂配合物的结构研究(
R(右)
)-普萘洛尔
I.G.穆尼奥斯
,
S.L.莫布雷
和
J.圣赫伯格
1.5
主要纤维素酶催化域的结构
白腐真菌
Cel7D(CBH 58)对该酶家族中对映选择性的基础提供了新的见解。
PDB参考
:
Cel7D催化域,1h46,r1h46sf
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《水晶学报》。
(2003年)。
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59
,
644-653
doi:10.1107/S090744490300194X
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二聚体细胞色素的结构
c
三
从
巨大脱硫弧菌
1.2时
奥数分辨率
D.阿拉戈
,
C.弗雷佐
,
L.西克
,
G.M.谢尔德里克
,
J.勒加尔
和
M.A.Carrondo先生
二聚细胞色素的高分辨率精制
c
三
以及与所有其他已知的详细序列和结构比较
c
三
描述了域。
PDB参考
:
细胞色素
c
三
,1gyo,r1gyosf
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(2003年)。
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59
,
654-661
doi:10.1107/S0907444903001951
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吡啶[2,3的两种多态性分析-
d日
]嘧啶N9-C10反桥反叶酸二元复合物与人二氢叶酸还原酶
V.科迪
,
N.加利茨基
,
J.R.勒夫特
,
W.A.庞本
和
A.冈吉
人二氢叶酸还原酶与强效N9-C10反桥抗酸抑制剂2,4-二氨基-6二元络合物的结构测定-[
N个
-(3′,4′,5′-三甲氧基苄基)-
N个
-甲胺基]吡啶[2,3-
d日
]据报道,嘧啶是两个独立的多态性菱形体
R(右)
3格。
PDB参考
:
2,4-二氨基-6-[
N个
-(3′,4′,5′-三甲氧基苄基)-
N个
-甲胺基]吡啶[2,3-
d日
]嘧啶-hDHFR复合物(1),1mvs,r1mvssf
;
复数(2),1mvt,r1mvtsf
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《水晶学报》。
(2003年)。
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59
,
662-669
doi:10.1107/S0907444903002129
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SAD或MAD定相:异常散射体的位置
M.C.伯拉
,
B.卡罗齐尼
,
G.L.卡斯卡拉诺
,
C.贾科瓦佐
和
G.波利多里
描述了在SAD和MAD情况下定位异常散射体的程序。
阅读文章
《水晶学报》。
(2003年)。
D类
59
,
670-676
doi:10.1107/S0907444903002208
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立方胰岛素晶体的结晶滴定:pH对Glu的影响
B类
13开关和硫酸盐结合
J.刁
谷氨酸双构象的占有率变化
B类
13表征了依赖于pH的动态切换过程。
随着pH值的增加,硫酸盐离子的占有率降低。
比较观察到的结构因子和结构表明,猪胰岛素的结构随着pH值的变化而逐渐变化。
PDB参考
:
立方胰岛素,pH 5.00,1b17,r1b17sf
;
pH值5.53,1b18,r1b18sf
;
pH值5.80,1b19,r1b19sf
;
pH 6.00,1b2a,r1b2asf
;
pH值6.16,1b2b,r1b2bsf
;
pH值6.26,1b2c,r1b2csf
;
pH值6.35,1b2d,r1b2dsf
;
pH 6.50,1b2e,r1b2esf
;
pH 6.98,1b2f,r1b2fsf
;
pH值9.00,1b2g,r1b2gsf
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《水晶学报》。
(2003年)。
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59
,
677-687
doi:10.1107/S0907444903002233
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1.3
用于诱导膜蛋白结晶的抗体Fv片段的光学X射线结构
L.-O.埃森
,
A.哈伦加
,
C.Ostermier公司
和
H.米歇尔
针对细胞色素的抗体Fv片段7E2的结构
c
氧化酶来自
脱氮副球菌
结果表明,可变结构域沿其骨架区域具有高度保守的溶剂壳层。
这种结构揭示了疏水核内部的局部“呼吸”,一种新的CDR-L3环构象和V的特殊差异
H(H)
/V(V)
L(左)
-配对。
PDB参考
:
未连接的7E2 Fv片段,1mqk,r1mqksf
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《水晶学报》。
(2003年)。
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59
,
688-696
doi:10.1107/S0907444903002646
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硫异常信号的现场测量及其在相位调整中的应用
《期刊》。
德布赖采尼
,
G.邦科奇
,
Q.马
,
H.Blaser公司
和
G.M.谢尔德里克
主要基于内部测量的硫异常散射的SAD定相导致了五种标准测试蛋白的易于解释的图谱。
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《水晶学报》。
(2003年)。
D类
59
,
697-708
doi:10.1107/S0907444903002713
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蛋白质晶体的热传递:闪速冷却和X射线束加热的意义
S.克里姆斯基
,
M.卡兹米尔扎克
和
R.E.索恩
蛋白质晶体的传热分析用于确定影响低温X射线数据收集程序成功的实验参数的优先级,并评估通过X射线吸收减少晶体加热的方法。
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《水晶学报》。
(2003年)。
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59
,
709-718
doi:10.1010/S0907444903002889
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通过23维分子置换搜索确定小蛋白的结构
N.M.Glykos公司
和
M.科基尼迪斯
一种随机多维分子置换方法已成功应用于23维问题。
PDB参考
:
A31P Rop,1gmg,r1gmgsf
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结晶纸
《水晶学报》。
(2003年)。
D类
59
,
719-720
doi:10.1107/S0907444902022527
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DNA甲基转移酶HP1352的克隆、表达、纯化、结晶和初步X射线衍射分析
幽门螺杆菌
K.Schirwitz公司
,
A.伦丁
,
A.斯科格伦德
,
M.克拉布
,
L.Engstrand公司
和
C.恩罗斯
DNA甲基转移酶HP1352的晶体
幽门螺杆菌
已获得,衍射到2.5
奥分辨率。
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《水晶学报》。
(2003年)。
D类
59
,
721-723
doi:10.1107/S0907444903001987
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α的结晶和初步X射线数据
2
∊
2
乙酰辅酶A脱羰基酶/合成酶复合物的亚组分
甲烷八叠球菌
P.巴尔博
和
奥利维拉先生
Ni/Fe–S相关α
2
∊
2
乙酰辅酶A脱羧酶/合成酶的亚组分
嗜热分枝杆菌
纯化并结晶。
晶体安装在毛细管中,衍射到4.0
Å分辨率在室温下使用同步辐射源。
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《水晶学报》。
(2003年)。
D类
59
,
724-726
doi:10.1010/S0907444903002063
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人α-肌动蛋白肌动蛋白结合域的结晶:SeMet标记蛋白微晶的分析
F.Ekström
,
G.斯蒂尔
和
U.H.绍尔
人α-肌动蛋白的肌动蛋白结合域已被克隆、表达和结晶。
使用微聚焦同步辐射X射线束从硒代蛋氨酸标记蛋白的微晶中收集单波长异常色散数据。
阅读文章
《水晶学报》。
(2003年)。
D类
59
,
727-729
doi:10.1107/S0907444903002117
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牛血清中胺氧化酶的结晶和初步X射线数据
V.卡尔德隆
,
M.L.Di Paolo先生
,
M.Trabucco先生
,
M.比亚德内
,
R.巴蒂斯塔
,
A.里戈
和
G.扎诺蒂
对牛血清中的含铜胺氧化酶(BSAO)进行了脱糖和结晶。
晶体属于空间群
P(P)
2
1
2
1
2
1
,在不对称单元中含有二聚体。
阅读文章
《水晶学报》。
(2003年)。
D类
59
,
730-733
doi:10.1107/S0907444903002191
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AHP IX-bp,一种锌离子和pH-依赖性凝血因子IX结合蛋白的纯化、结晶和初步晶体分析
蝮蛇
Pallas毒液
J.臧
,
M.滕
和
L.Niu(牛)
AHP IX-bp是一种新的凝血因子IX结合蛋白,从
A.海利斯
部分描述了Pallas及其生化特性。
获得了两种不同pH条件下的AHP IX-bp晶体,并分别收集和还原了X射线衍射数据。
阅读文章
《水晶学报》。
(2003年)。
D类
59
,
734-736
doi:10.1010/S0907444903002245
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嗜热蓝细菌铁氧还蛋白的纯化、结晶及初步X射线分析
层粘连性睫状肌
A.鱼类
,
M.勒本迪克
,
R.Nechushtai先生
和
O.利夫纳
铁氧还蛋白来源
层粘连分枝杆菌
已被纯化和结晶。
未来确定的晶体结构有望为诱导蛋白质热稳定性的因素提供有价值的数据。
阅读文章
《水晶学报》。
(2003年)。
D类
59
,
737-740
doi:10.1107/S0907444903002671
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两种nudix水解酶的纯化、结晶和初步X射线分析
耐辐射球菌
E.L.霍尔布鲁克
,
U.Schulze-Gahmen公司
,
G.W.布奇科
,
S.镍
,
M.A.肯尼迪
和
S.R.霍尔布鲁克
来自抗辐射细菌的两种推测的nudix水解酶DR1025和DR0079
D.耐辐射药物
表达、纯化、结晶,并收集到1.4和1.9的衍射数据
分别为?分辨率。
异常衍射数据测量值为1.8
Sm的分辨率
3+
DR1025的衍生物。
阅读文章
《水晶学报》。
(2003年)。
D类
59
,
741-743
doi:10.1107/S0907444903002634
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天然和硒代蛋氨酸2-羟基联苯3-单加氧酶的结晶和初步X射线分析
A.梅耶
,
D.坦纳
,
A.施密德
,
D.F.萨金特
,
H.-P.E.科勒
和
B.螺栓
2-羟基联苯-3-单加氧酶(HbpA)来自
阿泽莱卡假单胞菌
HBP1结晶为天然和硒代蛋氨酸标记蛋白(SeMet-HbpA)。
从这些晶体中收集到的衍射数据分辨率为2.0
本地和2.25
O代表SeMet HbpA。
阅读文章
《水晶学报》。
(2003年)。
D类
59
,
744-746
doi:10.1107/S0907444903002890
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小麦的结晶及X射线衍射初步研究(
小麦
L.)TAXI型内切木聚糖酶抑制剂
圣桑(S.Sansen)
,
C.动词
,
C.德兰特
,
K.Gebruers公司
,
K.Brijs公司
,
C.M.科廷
,
J.A.德尔科
和
A.拉比恩斯
内切木聚糖酶抑制剂的晶体
小麦
已经准备好并证明适合成功的结构分析。
阅读文章
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(2003年)。
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,
747-748
doi:10.1107/S0907444903003044
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……的提纯、表征和初步X射线晶体学研究
淋病奈瑟菌
甘氨酸ORF1
D.N.阿维德森
,
R.F.皮尔逊
和
C.G.阿维德森
重组Gly1ORF1已被表达、纯化和结晶。
针对三维结构解决方案,还制备了SeMet取代晶体
通过
MAD方法。
阅读文章
《水晶学报》。
(2003年)。
D类
59
,
749-751
doi:10.1107/S0907444903003299
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HemAT趋气受体传感器结构域的结晶和X射线衍射分析
W.Zhang先生
和
小G.N.菲利普斯
HemAT蛋白负责感知
枯草芽孢杆菌
HemAT的传感器域被克隆、表达、结晶,其结构通过MAD方法确定。
阅读文章
《水晶学报》。
(2003年)。
D类
59
,
752-754
doi:10.1107/S0907444903008
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鱼基质血红蛋白-II的结晶、初步X射线分析和分子置换溶液(
头石脂鲤
)
J.C.L.丰塞卡
,
R.T.本田
,
P.德拉托雷
,
V.法德尔
,
G.O.博尼拉·罗德里格斯
和
小W.F.de Azevedo
鱼基质中主要血红蛋白(BcHb-II)的结晶和初步X射线分析(
B.头
)已报告。
阅读文章
《水晶学报》。
(2003年)。
D类
59
,
755-757
doi:10.1107/S0907444903003718
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提纯、结晶和初步X射线分析
粪肠球菌
蛋白质EF0377
A.Riboldi-Tunnicliffe公司
,
C.J.本特
,
N.W.Isaacs公司
和
T·J·米切尔
报道了EF0377的结晶和初步的X射线衍射。
阅读文章
《水晶学报》。
(2003年)。
D类
59
,
758-760
doi:10.1010/S090744490300372X
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云母受体结构域的克隆、过表达、纯化、结晶和初步衍射分析
C.J.本特
,
N.W.Isaacs公司
,
T·J·米切尔
和
A.Riboldi-Tunnicliffe公司
第14页
来自的MicA响应调节器的kDa接收器域
肺炎链球菌
已结晶并记录了其初步晶体学数据。
阅读文章
《水晶学报》。
(2003年)。
D类
59
,
761-764
doi:10.1107/S0907444903002920
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一种新的海洋甲藻荧光素酶活性结构域的表征和结晶
L·刘
,
H.进口
,
M.Cegielski先生
,
P.勒马盖雷斯
,
L.W.舒尔茨
,
K.L.克劳斯
和
J.W.黑斯廷斯
从甲藻荧光素酶中制备并结晶了两个与海水生物发光有关的同源结构域。
域D2在空间群中结晶
P(P)
2
1
2
1
2
1
衍射到2.8
在旋转阳极上。
空间群生长D3畴晶体
P(P)
2
1
2
1
2
1
衍射到2.3
在旋转阳极上。
阅读文章
短通信
《水晶学报》。
(2003年)。
D类
59
,
765-768
doi:10.1107/S0907444903002051
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20K内切葡聚糖酶的结构
白黑果霉
在1.8
奥数分辨率
J.瓦尔贾卡
和
J.鲁维宁
嗜热真菌中非复合20K内切葡聚糖酶的三维结构
白念珠菌
与先前确定的45家族内切葡聚糖酶的内切葡聚糖酶的内切酶基本相似,只是链V和链VI之间的柔性环排列有序。
现在可以比较该家族的嗜热和嗜中温内切葡聚糖酶。
PDB参考
:
20K内切葡聚糖酶,1l8f,r1l8fsf
阅读文章
《水晶学报》。
(2003年)。
D类
59
,
769-772
doi:10.1107/S0907444903002919
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三种商用稀疏矩阵结晶筛的比较
J.W.吴
,
R.D.基德
,
J.L.马丁
和
B.神户
使用19种不同的蛋白质比较了三种商用结晶筛的效率。
该研究确定了这些筛网中最成功的结晶条件以及单个结晶成分有效性的一些一般趋势。
阅读文章
《水晶学报》。
(2003年)。
D类
59
,
773-776
doi:10.1107/S0907444903002178
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胶原蛋白样多肽(PPG)的结晶
10
登上国际空间站。
3.剩余加速度诱发运动分析
D.卡斯塔尼奥洛
,
C.短笛
,
胡萝卜乳杆菌
,
A.维加拉
和
A.扎加里
已结合观测数据(PPG)对国际空间站上记录的加速度数据进行了分析
10
晶体运动和晶体质量。
阅读文章
国际结晶学联合会
《水晶学报》。
(2003年)。
D类
59
,
777-782
doi:10.1107/S0907444903000805
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