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探针Cons

swMATH ID:	12014
软件作者：	Chuong B.Do；Mahathi S.P.Mahabhashyam；迈克尔·布鲁德诺；塞拉菲姆·巴佐格鲁
描述：	ProbCons：基于概率一致性的多序列比对。为了研究广泛生物的基因进化，生物学家需要准确的工具来对蛋白质家族进行多序列比对。然而，获得精确的对准是一个困难的计算问题，因为不仅计算成本高，而且缺乏用于测量对准质量的适当目标函数。在本文中，我们引入了概率一致性，这是一种用于多序列比较的新型评分函数。我们提出了ProbCons，这是一种基于概率一致性的渐进式蛋白质多序列比对的实用工具，并在几个标准比对基准数据集上评估了其性能。在BAliBASE、SABmark和PREFAB基准比对数据库中，ProbCons在保持实际速度的同时，与其他领先方法相比取得了显著的统计改进。ProbCons作为Web资源公开提供。
主页：	http://genome.cshlp.org/content/15/2/330
相关软件：	肌肉；MAFFT公司；ClustalW公司；T-咖啡；DIALIGN公司；巴利巴斯；Probalin公司；卡林；3D咖啡；木乃伊；直径-TX；SAB标记；Clustal X公司；MSA探测器；普法姆；M-咖啡；充分满足；莫韦；OXBench公司；部件树
引用于：	10文件

1	阿娜·阿里巴斯·吉尔
1	Sarah J.Berkemer。
1	阿里·达巴
1	朱拉特·道格莱特
1	丹·德布拉西奥
1	范晓丹
1	郭宣
1	克里斯蒂安·Höner zu Siederdessen
1	John D.Kececioglu。
1	Lárraga-Ramírez，María E。
1	刘军S。
1	凯瑟琳·马蒂亚斯
1	罗曼·安塞尔莫（Roman Anselmo），莫拉古蒂埃雷斯（Mora-Gutiérrez）
1	盛田贤介
1	Nguyen，Ken（肯·阮）
1	艾斯林·奥德里斯科尔
1	潘毅
1	安东尼·庞西奇。
1	哈维尔·拉米雷斯-罗德里格斯
1	Rincón-García，Eric Alfredo
1	靖国坂原
1	佐藤、肯戈
1	罗伊·D·斯莱特。
1	彼得·斯塔德勒（Peter F.Stadler）。
1	阿卜杜勒卡梅尔·塔里
1	Tandy J.沃诺。
1	元，元
1	贾法尔·邹阿什