充分满足 swMATH ID: 24610 软件作者: Liu K、Warnow TJ、Holder MT、Nelesen SM、Yu J、Stamatakis AP、Linder CR。 描述: SATe:SATé-同时对齐和树估计。SATé是一个用于推断序列比对和系统发育树的软件包。迭代算法涉及重复的对齐和树搜索操作。原始数据集通过基于树的分解被划分为更小的子问题。这些子问题被对齐并进一步合并以进行系统发育树推断。堪萨斯大学开发的实现由Jiaye Yu、Mark Holder、Jeet Sukumaran、Siavash Mirarab和Jamie Oaks编写。默认情况下,此实现使用“SATé-II fast”设置(但请参阅下面关于影响2.2.2之前版本的错误的“已知问题”部分)。对齐和树搜索例程通过调用非我们编写的“外部”程序(但与SATé发行版捆绑在一起)来实现。刘等人2009年描述了SATé的原始风格。此处发布的版本支持Liu等人2012所述的SATé-II搜索。 主页: http://phylo.bio.ku.edu/software/sate/sate.html 相关软件: 探针Cons;普罗瓦林;莫韦;OXBench公司;SAB标记;Bali-phy公司;Statalign公司;卡林;肌肉;ClustalW公司;巴利巴斯;巴克;PAUP公司*;野兽;国际GTP;防护测试3;贝叶斯先生;盖杰内斯;POY公司;MLTreeMap(MLTree地图) 引用于: 3文件 5位作者引用 1 丹·德布拉西奥 1 John D.Kececioglu。 1 布雷特·R·拉格特。 1 西贡Shim 1 Tandy J.沃诺。 2篇连载文章中引用 1 生物计量学 1 计算生物学 在2个字段中引用 三 生物学和其他自然科学(92-XX) 1 统计学(62-XX) 按年份列出的引文