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莫韦

swMATH ID: 24606
软件作者： Darling AC、Mau B、Blattner FR、Perna NT
描述： Mauve：具有重排的保守基因组序列的多重比对。随着基因组的进化，它们经历了大规模的进化过程，这对不是由短序列构成的序列比较提出了挑战。重组会导致频繁的基因组重排，水平转移会将新序列引入细菌染色体，而缺失会删除基因组片段。因此，每个基因组都是由独特的谱系特异片段、与其他基因组子集共享的区域以及在考虑中的所有基因组中保守的片段组成的马赛克。此外，这些片段的线性顺序可能会在基因组之间发生改变。我们提出了在存在重排和水平转移的情况下鉴定和校准保守基因组DNA的方法。我们的方法已经在一个名为Mauve的软件包中实现。Mauve已被应用于对齐九个肠杆菌基因组，并确定三种哺乳动物基因组中的全球重排结构。我们已经评估了Mauve比对的质量，并通过广泛的基因组进化模拟与其他方法进行了比较。
主页： http://darlinglab.org/mauve/mauve.html
相关软件： OXBench公司;拉根;ClustalW公司;T-咖啡;BLASTZ公司;BLAT（爆炸）;KEGG公司;普罗瓦林;充分满足;探针Cons;PAUP公司*;贝叶斯先生;SAB标记;无间道;马格西;卡林;肌肉;HMMER公司;巴利巴斯;生物GAP
引用于： 11文件
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36位作者引用

三 安德鲁·弗朗西斯。
2 艾格里·纳吉，阿提拉
2 沃尔克·格伯哈特
1 鲍朝晖
1 桑吉塔·巴蒂亚
1 马里利亚·D·V·布拉加。
1 塞德里克·乔夫
1 查德·克拉克
1 戴，齐
1 丹·德布拉西奥
1 丹尼尔·多尔
1 阿菲夫·埃尔格拉乌伊
1 穆拉德·埃卢米
1 佩德罗·费约
1 何平安
1 凯瑟琳·贾恩
1 John D.Kececioglu。
1 李家栋
1 克莱尔·勒迈特尔
1 刘晓庆
1 吕金龙
1 西亚瓦什·米拉拉布
1
1 法国玛丽·萨戈
1 Shieh，Yi-Kung先生
1 Shyu、Shyong Jian
1 Jens Stoye
1 克里斯特·斯文森（Krister M.Swenson）。
1 Mark M.田中。
1 陶，金
1 安妮莉丝·塞韦宁
1 法拉马茨·瓦拉法
1 Tandy J.沃诺。
1 马蒂亚斯·韦勒
1 杨思倩
1 阿尔伯特·Y·佐马亚。
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6篇连载文章中引用

2 理论计算机科学
1 数学生物学杂志
1 数学生物学通报
1 计算生物学
1 离散数学、算法和应用
1 理论生物学杂志
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在7个字段中引用

11 生物学和其他自然科学（92-XX）
2 计算机科学（68至XX）
1 总体主题；集合（00-XX）
1 组合数学（05-XX）
1 阶、格、有序代数结构（06-XX）
1 群论与推广（20-XX）
1 统计学（62-XX）

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