拨号发送

DIALIGN-TX:基于片段的多序列比对的贪婪渐进方法。背景:DIALIGN-T是多重对齐程序dialgign的一个重新实现。由于一些算法上的改进,它在局部和全局相关的序列集上产生比以前版本的DIALIGN更好的对齐。然而,与该程序的最初实现一样,DIALIGN-T使用一种直接贪婪的方法从局部成对序列相似性集合多个比对。这种贪婪的方法可能容易受到虚假随机相似性的影响,因此可能导致次优结果。在本文中,我们提出了diaign-TX,它是diaign-T的一个实质性的改进,它结合了我们以前的贪婪算法和渐进对齐方法。


zbMATH中的参考文献(参考文献7条)

显示结果1到7,共7个。
按年份排序(引用)

  1. 脱臼,丹;Kececioglu,John:多序列比对的参数建议(2017)
  2. 莫拉古铁雷斯,罗马安塞尔莫;拉加·拉米雷斯,马里亚。;Rinconón-García,埃里克a。;伊希奇,安东宁;Ramírez Rodríguez,Javier:为解决多序列对齐问题而改编的音乐创作方法(2015)
  3. 费德里科,玛丽亚;彼得龙戈,皮埃尔;皮桑蒂,娜迪亚;萨戈特,玛丽·法国:\textscRime:重复识别(2014)
  4. 迪迪埃,吉尔;科雷尔,爱德华多;拉普雷沃特,伊万;格罗斯曼,亚历克斯;Landès-Devauchelle,Claudine:可变长度局部解码和无对齐序列比较(2012)
  5. 迪卢西奥,埃里克;Koehl,Patrice:同源建模的质量度量:H因子(2011)ioport公司
  6. 金,杰布姆;索拉布,辛哈:非编码序列多重比对的现实基准(2010)ioport公司
  7. 费边·施赖伯;皮克,克斯汀;艾本贝克,德克;Wörheide,格特;Morgenstern,Burkhard:Orthoselect:在系统基因组学中选择同源组的协议(2009)ioport公司