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    最小1层粘连蛋白B1[褐家鼠(挪威鼠)]

    基因ID:116685,更新日期2024年4月11日

    总结

    官方符号
    最小1由提供RGD公司
    官方全名
    层粘连蛋白B1由提供RGD公司
    主要来源
    RGD:620522
    请参阅相关
    恩森布尔:ENSRNOG00000013774 联盟基因组:RGD:620522
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    已验证
    有机体
    褐家鼠
    血统
    真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria属;尤阿古托格利尔斯;闪光;啮齿动物;肌形态;鼠形目;鼠科;穆里奈;大鼠
    总结
    预计可实现磷脂酶结合活性和序列特异性双链DNA结合活性。参与几个过程,包括细胞对皮质酮刺激的反应;细胞对谷氨酸钠的反应;以及对抗生素的反应。位于细胞质中;核膜;和核外围。该基因的人类直系同源基因与成人型常染色体显性脱髓鞘性脑白质营养不良和原发性常染色体隐性小头畸形有关。与人类LMNB1(层粘连蛋白B1)同源。【由基因组资源联盟提供,2022年4月】
    表达式
    胸腺(RPKM 293.4)、脾脏(RPKM185.8)和9个其他组织中的偏倚表达查看更多信息
    直系同源
    新款
    尝试新的基因表
    尝试新的成绩单表

    基因组背景

    参见中的Lmnb1基因组数据查看器
    地点:
    18季度12.1
    外显子计数:
    11
    注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
    RS_2024_02号 现在的 GRCr8型(GCF_036323735.1号) 18 NC_086036.1(52373939..52413284)
    RS_2023_06号 上一个程序集 额定BN7.2(GCF_015227675.2号) 18 NC_051353.1(50175861..50215210)
    106 上一个程序集 雷诺_6.0(GCF_ 000001895.5) 18 NC_005117.4(51785111..51822264)

    染色体18-NC_086036.1描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene sperm microtubule inner protein 10 Neighboring gene uncharacterized LOC134483028 Neighboring gene uncharacterized LOC120098251 Neighboring gene membrane associated ring-CH-type finger 3 Neighboring gene small ribosomal subunit protein uS3-like Neighboring gene uncharacterized LOC120098149 Neighboring gene similar to human chromosome 5 open reading frame 63

    基因组区域、转录物和产物

    表达式

    • 项目名称:跨越11个器官和4个发育阶段的大鼠RNA-Seq转录体BodyMap
    • 描述:从Fischer 344大鼠的11个器官(肾上腺、大脑、心脏、肾脏、肝脏、肺、肌肉、脾脏、胸腺和睾丸或子宫)中分离出320个RNA样本,这些器官来自于四个发育阶段(2-、6-、21-和104周龄)的雌雄大鼠
    • 生物项目:项目编号:238328
    • 出版物:PMID 24510058
    • 分析日期:2016年6月6日星期一17:44:12

    参考文献

    PubChem的途径

    互动

    产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

    一般基因信息

    标记

    基因本体论 RGD提供

    组件 证据代码 酒吧
    位于中间灯丝中 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    位于层粘连丝中 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    位于层粘连丝中 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    在核外壳内活动 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    位于核膜内 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    位于核膜内 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    位于核膜内 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    定位于核内膜 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    定位于核内膜 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    在核膜中是活跃的 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    位于核膜内 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    位于核膜内 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    在核膜中是活跃的 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    位于核纤层中 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    在核矩阵中定位 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    在核矩阵中定位 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    在核矩阵中定位 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    定位核膜 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    定位核膜 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    位于核外围 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    核质定位 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    核质定位 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    位于核内 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     

    NCBI参考序列(RefSeq)

    新款 尝试新的成绩单表

    独立于注释的RefSeq维护基因组

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

    mRNA和蛋白质

    1. NM_053905.2号NP_446357.2号层粘连蛋白B1

      状态:已验证

      源序列
      日本宇宙航空研究开发委员会Z01000018
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      第70615页
      UniProtKB/TrEMBL公司
      A6IX67型,G3V7U4型
      相关的
      ENSRNOP00000019351.3号文件,ensrnot0000019351.6欧元
      保守领域(2)总结
      pfam00038型
      地点:31387
      长丝;中间丝蛋白
      pfam00932型
      地点:439542
      有限公司;拉明尾域

    注释基因组的参考序列:GCF_036323735.1-RS_2024_02

    以下部分包含属于特定基因组构建。解释

    参考GRCr8

    基因组学

    1. NC_086036.1参考GRCr8

      范围
      52373939..52413284
      下载
      GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)