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    低分子量脂蛋白B1拉明B1褐家鼠(挪威鼠)

    基因ID:116685,更新于13-JAN-2020

    概要

    官方符号
    低分子量脂蛋白B1提供的RGD
    官方全名
    拉明B1提供的RGD
    主要来源
    RGD:620522
    见相关
    SCONBLL:EnrNoG090001374
    基因型
    蛋白质编码
    RefSEQ状态
    临时的
    有机体
    褐家鼠
    血统
    真核生物;后生动物;脊索动物;Craniata;脊椎动物;Euteleostomi;Mammalia;Euthista;Euarchontoglires;Glires;啮齿目;Myomorpha;Muroidea;
    概要
    人类同源物是一种核纤层蛋白,涉及核稳定性、染色质结构和基因表达[RGD,FEB 2006 ]。
    表情
    胸腺(RPKM 293.4)、脾脏(RPKM 185.8)和9种其他组织中的有偏表达查看更多
    直系同源

    基因组背景

    位置
    18Q2.1
    外显子计数:
    十一
    注释发布 地位 装配 CHR 位置
    一百零六 现在的 RNORYO6GCFI 00000 1895.5 十八 NCY0.5174(51785111…51822264)
    一百零六 现在的 朗塞雷拉GCFI 00000 2265.2 十八 ACY0000 861(48320757…48358598)
    一百零四 以前的装配 RNORY5.0GCFI 00000 1895.4 十八 NCY0.5173(50979862…51018232)

    18号染色体NCY035174描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene testis expressed 43 Neighboring gene uncharacterized LOC102552038 Neighboring gene membrane associated ring-CH-type finger 3 Neighboring gene 40S ribosomal protein S3-like Neighboring gene uncharacterized LOC102552123

    基因组区域、转录物和产品

    表情

    • 项目名称:11个器官和4个发育阶段的大鼠RNA Seq transcriptomic BodyMap
    • 描述:从四个发育阶段(2、6、21、104周)的菲舍尔344只大鼠中,从11个器官(肾上腺、脑、心脏、肾脏、肝脏、肺、肌肉、脾脏、胸腺、睾丸或子宫)中分离出320个RNA样本。
    • BioProject:PRJNA88328
    • 发表PMED 24510058
    • 分析日期:6月6日星期一17:44∶12 2016

    参考文献

    蛹的途径

    交互作用

    产品 相互作用物 其他基因 复合物 来源 酒馆 描述

    一般基因信息

    马克笔

    同源性

    基因本体论 RGD提供

    过程 证据代码 酒馆
    凋亡过程 IEP
    从表达模式推断
    更多信息
    PubMedγ
    皮质酮刺激的细胞反应 IEP
    从表达模式推断
    更多信息
    PubMedγ
    谷氨酸单钠的细胞反应 国际开发协会
    直接测定推断
    更多信息
    PubMedγ
    有机环化合物的细胞反应 IEP
    从表达模式推断
    更多信息
    PubMedγ
    神经发生 IEP
    从表达模式推断
    更多信息
    PubMedγ
    抗生素反应 IEP
    从表达模式推断
    更多信息
    PubMedγ
    药物反应 IEP
    从表达模式推断
    更多信息
    PubMedγ

    NCBI参考序列(ReFSEQ)

    独立于注释的基因组的ReqsQS保持

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列与基因组注释周期无关,因此它们的版本可能与当前基因组构建中的RefSEQ版本不匹配。通过将此部分中的ReFSEQ版本与所报告的版本进行比较来识别版本不匹配。基因组区域、转录产物和产物上面。

    mRNA和蛋白

    1. NMY053905.1渐次NP4266357.1LAMIN B1

      参见NPY44 6357.1相同蛋白及其注释位置

      现状:临时

      源序列(s)
      U723
      UnPrimkb/瑞士PROT
      P70615
      相关
      Enrnop0900019351.3EnrrNo.000 000 19351.5
      守恒域(2)概要
      PFAM000 038
      位置三十一渐次三百八十七
      中间丝蛋白
      PFAM900932
      位置四百三十九渐次五百四十三
      拉明尾域

    注释基因组Reqsqs:褐家鼠注释106版 详情在新选项卡中打开此链接

    以下部分包含属于特定基因组构建的参考序列。解释

    参考RNORY6主组件

    基因组

    1. NCY0.5174.4基准RNORY$6主组件

      范围
      51785111…51822264
      下载
      基因银行FASTA序列查看器(图形)

    轮替塞拉

    基因组

    1. ACY090081.1交替RNE-Celela

      范围
      48320757…48358598
      下载
      基因银行FASTA序列查看器(图形)