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最小1层粘连蛋白B1[小家鼠(家鼠)]

基因ID:16906,更新日期2024年4月30日

摘要

官方符号
最小1由提供MGI公司
官方全名
层粘连蛋白B1由提供MGI公司
主要来源
MGI:MGI:96795
请参阅相关
乐团:ENSMUSG00000024590 联盟基因组:MGI:96795
基因类型
蛋白质编码
RefSeq状态
已验证
有机体
小家鼠
血统
真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;Euarchontoglires语;闪光;啮齿动物;肌形态;蘑菇总科;鼠科;穆里奈;穆斯;穆斯
摘要
具有磷脂酶结合活性和序列特异性双链DNA结合活性。预计参与细胞对谷氨酸钠的反应。位于核内膜和核腔内。以多种结构表达,包括消化系统;中枢神经系统;泌尿生殖系统;肌肉骨骼系统;和神经视网膜。用于研究成人型常染色体显性脱髓鞘性脑白质营养不良。该基因的人类直系同源基因与成人型常染色体显性脱髓鞘性脑白质营养不良和原发性常染色体隐性小头畸形有关。与人类LMNB1(层粘连蛋白B1)同源。【由基因组资源联盟提供,2022年4月】
表达式
在CNS E11.5(RPKM 89.9)、胸腺成体(RPKM41.9)和17个其他组织中广泛表达查看更多
直系同源
新款
尝试新的基因表
尝试新的成绩单表

基因组背景

位置:
18 D3;18 30.84立方厘米
外显子计数:
11
注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
RS_2024_02号 现在的 GRCm39型(GCF_000001635.27号) 18 NC_000084.7(56840885..56886496)
108.20200622 上一次装配 GRCm38.p6型(GCF_000001635.26号) 18 NC_000084.6(56707813..56753424)

染色体18-NC_000084.7描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene predicted gene, 50288 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_44668 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E5662 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E10992 Neighboring gene predicted gene, 41738 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_44677 Neighboring gene membrane associated ring-CH-type finger 3 Neighboring gene predicted gene 15345 Neighboring gene VISTA enhancer mm109 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E5663 Neighboring gene ribosomal protein S3 pseudogene

基因组区域、转录物和产物

表达式

  • 项目名称:鼠标ENCODE转录组数据
  • 描述:鼠标ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
  • 生物项目:PRJNA66167型
  • 出版物:PMID 25409824
  • 分析日期:无

参考文献

GeneRIFs:功能的基因引用

什么是GeneRIF?

变更

等位基因

这类等位基因在《小鼠基因组信息学》上有记载(MGI)

PubChem的途径

互动

产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

一般基因信息

标记

基因本体论 由MGI提供

过程 证据代码 酒吧
参与细胞对L-谷氨酸的反应 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与异染色质形成 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
参与核包络组织 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
参与核包络组织 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与核迁移 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
参与核孔定位 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
参与有丝分裂细胞周期G2/M转变的正调控 北美
不可追踪的作者声明
更多信息
公共医学 
参与JNK级联的正向调节 北美
不可追踪的作者声明
更多信息
公共医学 
参与蛋白核膜定位 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
组件 证据代码 酒吧
位于中间灯丝中 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
位于层粘连丝中 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
在核外壳内活动 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
位于核外壳内 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
核包膜共定位 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
位于核外壳内 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
位于核外壳内 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
 
位于细胞核内膜内 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
在核膜中是活跃的 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
在核膜中是活跃的 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
位于核膜内 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
在核矩阵中定位 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
在核矩阵中定位 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
定位核膜 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
位于核外围 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
核质定位 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
核质定位 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
 
位于核内 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
位于核内 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 

NCBI参考序列(RefSeq)

新款 尝试新的成绩单表

独立于注释的RefSeq维护基因组

这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

mRNA和蛋白质

  1. NM_010721.2号NP_034851.2号层粘连蛋白B1

    参见NP_034851.2的相同蛋白质及其注释位置

    状态:已验证

    源序列
    AK132252、BC052729
    共识CDS
    CCDS29261.1号文件
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    第14733页,Q61791问题
    相关
    ENSMUSP000000025486.9号,ENSMUST00000025486.9
    保留域(2)总结
    pfam00038型
    位置:32388
    长丝;中间丝蛋白
    pfam00932型
    位置:440544
    有限公司;拉明尾域

注释基因组的参考序列:GCF_000001635.27-RS_2024_02

以下部分包含属于特定基因组构建。解释

参考GRCm39 C57BL/6J

基因组学

  1. NC_000084.7参考GRCm39 C57BL/6J

    范围
    56840885..56886496
    下载
    GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)