biovizBase公司
基因组数据可视化的基本图形工具。
生物导体版本：释放（3.19）
biovizBase包旨在为基因组数据提供一组实用程序、颜色方案和约定。它是各种生物数据可视化高级包的基础。这样可以节省开发工作并鼓励一致性。
作者：尹腾飞[aut]、迈克尔·劳伦斯[aut，ths，cre]、戴安娜·库克[aut、ths]、约翰·雷纳[ctb]
维护人员：迈克尔·劳伦斯
引文（从R中输入引文（“biovizBase”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“biovizBase”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览渐晕图（“biovizBase”）
细节
| 生物视图 |
基础设施,预处理,软件,可视化 |
| 版本 |
1.52.0 |
| 在生物导体中 |
BioC 2.9（R-2.14）（13年） |
| 许可证 |
艺术-2.0 |
| 取决于 |
R（>=3.5.0），方法 |
| 进口 |
gr设备、统计信息，规模,Hmisc公司,R彩色啤酒,重铬酸盐,生物遗传学,S4载体(>= 0.23.19),I范围(>= 1.99.28),基因组信息Db(>= 1.5.14),基因组范围(>= 1.23.21),总结性实验,生物串(>= 2.33.11),Rsamtools软件(>= 1.17.28),基因组比对(>= 1.1.16),基因组特征(>= 1.21.19),注释Dbi,变量注释(>= 1.11.4),集成数据库(>= 1.99.13),批注筛选器(>= 0.99.8),爱尔兰航空公司 |
| 系统要求 |
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| 统一资源定位地址 |
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查看更多
| 建议 |
英国基因组。哈皮恩斯。加州大学圣保罗分校hg19,TxDb（发送日期）。哈皮恩斯。UCSC.hg19.known基因,牛基因组,rtracklayer公司,EnsDb公司。哈皮恩斯v75,RUnit（运行单位） |
| 链接到 |
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| 增强功能 |
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| 取决于我 |
咖啡馆 |
| 导入我 |
泡泡树,ChIPexoQual公司,ggbio公司,Gviz公司,核倍体R,Pviz公司,Rqc（质量控制） |
| 建议我 |
CINdex公司,少女,derfinder图,弗雷泽,NanoStringNC工具,外部,R3CPET公司,区域报告,闪亮的小鹅,结构变量注释,西尼亚克 |
| 指向我的链接 |
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| 生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
