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泡泡树

BubbleTree:利用下一代测序数据直观直观地阐明体细胞嵌合体中肿瘤非整倍体和克隆性


生物导体版本:发布(3.18)

各组肿瘤标本的CNV分析。

作者:Wei Zhu<zhuw at medimmune.com>,Michael Kuziora<kuzioram at medimmune.com>,Todd Creasy<crestyt at medimmune.com>,Brandon Higgs<higgsb at medimmune.com>

维护人员:Todd Creasy<creasyt at medimummene.com>,Wei Zhu<weizhu365 at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“BubbleTree”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“BubbleTree”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“泡泡树”)
气泡树教程 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 副本编号变化,新闻报道,排序,软件
版本 2.32.0
在生物导体中 生物技术3.1(R-3.2)(9年)
许可证 LGPL(>=3)
取决于 R(>=3.5),I范围,基因组范围、plyr、dplyr、magrittr
进口 生物遗传学(>=0.31.6),仿生风格,博科生物、ggplot2、WriteXLS、gtools、RColorBrewer、,利马,网格,gtable,gridExtra,biovizBase公司,e1071,方法,grDevices,stats,utils
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 气泡树_2.32.0.tar.gz
Windows二进制 BubbleTree_2.32.0.zip文件(仅64位)
macOS二进制(x86_64) 气泡树_2.32.0.tgz
macOS二进制(arm64) 气泡树_2.32.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BubbleTree网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/BubbleTree
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/BubbleTree/
包短Url https://bioconductor.org/packages/BubbleTree网站/
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