泡泡树
BubbleTree:利用下一代测序数据直观直观地阐明体细胞嵌合体中肿瘤非整倍体和克隆性
生物导体版本:发布(3.18)
各组肿瘤标本的CNV分析。
作者:Wei Zhu<zhuw at medimmune.com>,Michael Kuziora<kuzioram at medimmune.com>,Todd Creasy<crestyt at medimmune.com>,Brandon Higgs<higgsb at medimmune.com>
维护人员:Todd Creasy<creasyt at medimummene.com>,Wei Zhu<weizhu365 at gmail.com>
引文(从R中输入引文(“BubbleTree”)
):
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“BubbleTree”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“泡泡树”)
细节
生物视图 |
副本编号变化,新闻报道,排序,软件 |
版本 |
2.32.0 |
在生物导体中 |
生物技术3.1(R-3.2)(9年) |
许可证 |
LGPL(>=3) |
取决于 |
R(>=3.5),I范围,基因组范围、plyr、dplyr、magrittr |
进口 |
生物遗传学(>=0.31.6),仿生风格,博科生物、ggplot2、WriteXLS、gtools、RColorBrewer、,利马,网格,gtable,gridExtra,biovizBase公司,e1071,方法,grDevices,stats,utils |
系统要求 |
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统一资源定位地址 |
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查看更多
建议 |
knitr、rmarkdown |
链接到 |
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增强功能 |
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取决于我 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。