DMR类别

甲基化阵列和测序空间分析方法

生物导体版本：释放（3.19）

使用全基因组亚硫酸氢盐测序（WGBS）和Illumina Infinium阵列（450K和EPIC）数据从头识别和提取人类基因组中的差异甲基化区域（DMR）。提供过滤可能被SNP和杂交混淆的探针的功能。包括G范围生成和打印功能。

作者：蒂姆·彼得斯

维护人员：蒂姆·彼得斯（Tim Peters）<t.Peters at garvan.org.au>

引文（从R中输入引文（“DMRcate”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“DMRcate”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览Vignette（“DMR日期”）

生物视图	新闻报道,DNA甲基化,数据导入,差异表达式,差异甲基化,表观遗传学,基因表达,遗传学,基因组注释,甲基化阵列,微阵列,多重比较,一个频道,预处理,质量控制,排序,软件,时间课程,双通道,全基因组
版本	3.0.0
在生物导体中	生物技术2.14（R-3.1）（10年）
许可证	文件许可证
取决于	R（>=4.3.0）
进口	批注中心,实验中心,bsseq公司,基因组信息Db,利马,边缘R,米菲,甲基错误,基因组范围，年，Gviz公司,I范围，统计，实用程序，S4载体、方法、图形、，总结性实验,生物反应器，gr设备
系统要求
统一资源定位地址

建议	knitr、RUnit、，生物遗传学,IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19公司,Illumina人甲基化EPICanno.ilm10b4.hg19,流排序。鲜血。EPIC公司,组织Treg,DMR分类数据,EPICv2清单
链接到
增强功能
取决于我	咀嚼,甲基化阵列分析
导入我
建议我	甲基错误
指向我的链接
生成报告	生成报告

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源程序包	DMR日期_3.0.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制（x86_64）	DMR类别_3.0.0.tgz
macOS二进制（arm64）	DMR类别_3.0.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DMRcate
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/DMRcate
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/DMRrate网址/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/DMRcate/
软件包下载报告	下载统计信息
BioC 3.19的旧源程序包	源存档