流式排序。鲜血。EPIC公司

Illumina免疫磁性分类外周成人血细胞的EPIC数据

生物导体版本：释放（3.18）

minfi和类似软件包中用于血细胞比例估计的原始数据对象。FlowSorted。鲜血。EPIC对象基于Brock Christensen及其同事分析的样本；详见Salas等人2018。https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi？acc=GSE110554。

作者：Lucas A.Salas[cre，aut]，Devin C.Koestler[aut]、Rondi A.Butler[ctb]、Helen M.Hansen[ctb]、John K.Wiencke[ctb]]、Karl T.Kelsey[ctb]、Brock C.Christensen[Cttb]、Kasper Daniel Hansen[ctb][原始minfi估计CellCounts和内部函数的作者和维护者）、Jean-Philippe Fortin[ctb（原始minfi estimateCellCounts和内部函数的贡献者）、Shan V.Andrews[ctb]（原始minfi estimate CellCount和内部函数中的贡献者（原始estimateCellCounts和minfi内部函数的作者）

维护人员：卢卡斯·萨拉斯（Lucas A.Salas）<Lucas.A.Salas.diaz at dartmouth.edu>

引文（从R中输入引文（“FlowSorted.Blood.EPIC”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.3”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“FlowSorted.Blood.EPIC”）

对于旧版本的R，请参阅相应的生物导体释放.

文件

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“FlowSorted.Blood.EPIC”）

流式排序。鲜血。EPIC公司	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本

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细节

生物视图	实验数据,基因组,人乳头数据,甲基化阵列数据,微阵列数据,组织,组织微阵列数据
版本	2.6.0
许可证	GPL-3公司
取决于	R（>=3.5），米菲(>= 1.21.2),实验中心
进口	基因过滤器，nlme，quadprog，图形，统计，实用程序，批注中心,总结性实验,S4载体
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/immunomethylomics/FlowSorted.Blood.EPIC
错误报告	https://github.com/immunomethylomics/FlowSorted.Blood.EPIC/issues。

建议	针织者，rmarkdown，流排序。脐血450k,流排序。血量450k（>=1.0.1），EpiDISH公司,流排序。CordBlood挪威450k，测试，照度人体甲基化450kmanifest(>= 0.2.0),IlluminaHumanMethylationEPIC清单,IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19公司(>= 0.2.1),Illumina人甲基化EPICanno.ilm10b4.hg19
链接到
增强功能	流排序。脐血组合450k(>= 1.11.5)
取决于我
导入我	HiBED公司
建议我	DMR类别,流排序。脐血组合450k,瓦特瓜
指向我的链接
生成报告	生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	流排序。鲜血。EPIC_2.6.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制（x86_64）
macOS二进制（arm64）
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/FlowSorted.Blood.EPIC
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/FlowSorted。鲜血。EPIC公司
包短Url	https://bioconductor.org/packages/FlowSorted.Blood.EPIC网站/
软件包下载报告	下载统计信息