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如何:在其他生物体中找到基因的同源物

从…开始。。。

基因名称

  1. 搜索同源基因带有基因名称的数据库。如果你知道基因符号和有机体,那么使用这样的查询:tpo[gene name]and human[orgn]。
  2. 如果搜索找到多条记录,请单击所需的记录。同源基因列在报告的顶部。
  3. 如果在HomoloGene中搜索未返回任何记录,请搜索基因带有基因名称的数据库。
  4. 单击所需记录,然后单击页面右侧列表中的HomoloGene链接。
  5. 如果没有与同源基因的链接,请在基因记录的NCBI参考序列部分找到一个蛋白质参考序列(例如NP_005537),并按照下面“蛋白质登录号”下的说明进行操作。
  6. 如果基因记录中没有参考序列,请搜索蛋白质数据库中包含基因名称并选择所需的记录。然后按照下面“蛋白质登录号”下的说明进行操作。

蛋白质接入号(例如NP_005537)

  1. 搜索蛋白质数据库和登录号。
  2. 在报告的右侧,单击“有关xxx基因的更多信息”链接。然后在上面的“基因名称”下继续步骤4。
  3. 如果没有“关于xxx基因的更多信息”链接,那么NCBI很可能没有任何预先计算的基因同源物。点击页面右上角的蓝色链接菜单,然后点击链接至闪烁,您可以找到序列相似的潜在同源蛋白质列表。

核苷酸接入编号(例如NM_001126)

  1. 搜索核苷酸数据库和登录号。
  2. 在报告的右侧,单击“有关xxx基因的更多信息”链接。然后在上面的“基因名称”下继续步骤4。
  3. 如果没有与Gene的链接,请遵循与Protein的链接,然后在上面的“蛋白质登录号”下继续步骤2。

核苷酸序列

  1. 转到BLAST主页并单击Basic blast下的“nucleotide blast”。
  2. 将序列粘贴到查询框中。
  3. 在“有机体”框中输入感兴趣有机体的名称。单击BLAST按钮。
  4. 点击所需的记录,并在上述“核苷酸加入编号”下继续步骤2。

蛋白质序列

  1. 转到BLAST主页并单击Basic blast下的“protein blast”。
  2. 将序列粘贴到查询框中。
  3. 在“有机体”框中输入感兴趣有机体的名称。单击BLAST按钮。
  4. 单击所需的记录,然后在上面的“蛋白质登录号”下继续步骤2。