MStatsShiny公司

蛋白质组学实验统计分析的MSstats GUI

生物导体版本：释放（3.18）

MSstatsShiny是一个R-Shiny图形用户界面（GUI），与R包MSstats、MSstatsTMT和MSstatsPTM集成。它提供了一个适用于各种实验设计的点击式端到端分析管道。其中包括基于无标记或串联质量标签（TMT）的数据依赖性采集（DDA），以及DIA、SRM和PRM采集以及针对翻译后修饰（PTM）的采集。该应用程序自动保存用户选择，并构建一个R脚本来重新创建他们的分析，支持可复制数据分析。

作者：德文·科勒[aut，cre]，德里尔·拉朱[aut]，马纳萨·卡萨[aut].克里斯蒂娜·帕西[aut]，黄婷[aut〕，马特乌斯·斯坦尼亚克[aut'，达瓦尔·莫汉达斯[aut:

维护人员：德文·科勒（Devon Kohler）<Kohler.d at东北部.edu>

引文（从R中输入引文（“MSstatsShiny”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.3”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“MSstatsShiny”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“MSstatsShiny”）

MSstatsPTM LabelFree工作流	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式

需要帮助吗？请访问生物导体支持网站！

详细信息

生物视图	差异表达式，图形用户界面，免疫肿瘤学，质谱学，规范化，一个频道，蛋白质组学，质量控制，ShinyApps公司，软件，双通道
版本	1.4.3
在生物导体中	生物柴油3.16（R-4.2）（1.5年）
许可证	艺术-2.0
取决于	R（>=4.2）
进口	闪亮，闪亮BS，闪亮js，闪亮busy，dplyr，ggplot2，plotly，data.table，Hmisc，MS统计，MSstatsTMT公司，MS统计PTM，MS统计转换、gplots、，结婚，DT，readxl，ggresent，uuid，utils，stats，htmltools，methods，tidyr，grDevices，graphics，mokery
系统要求
统一资源定位地址
错误报告	https://github.com/Vitek-Lab/MSstatsShiny/issues（https://github.com/维泰克实验室/MSstatsShiny）

建议	rmarkdown、tinytest、sessioninfo、knitr、testhat（>=3.0.0）、shinytest2
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	MSstats中文_1.4.3.tar.gz
Windows二进制	MSstatsShiny_1.4.3.zip（仅64位）
macOS二进制（x86_64）	MSstatsShin_1.4.3.tgz公司
macOS二进制（arm64）	MSstatsShin_1.4.3.tgz公司
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MSstatsShiny网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：软件包/MStatsShiny
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/MSstatsShiny网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/MSstatsShiny网站/
软件包下载报告	下载统计信息
BioC 3.18的旧源程序包	源存档