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MS统计转换

从各种质谱信号处理工具将数据导入MSstats格式


生物导体版本:释放(3.18)

MSstatsConvert提供了将质谱数据处理工具的报告导入R格式的工具,该格式适合使用MSstats和MSstatsTMT包进行统计分析。

作者:Mateusz Staniak[aut,cre],Meena Choi[aut],Ting Huang[aut],Olga Vitek[aut'

维护人员:Mateusz Staniak<mstaniak.pl的mtst>

引文(从R中输入引文(“MSstatsConvert”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“MSstatsConvert”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“MSstatsConvert”)
使用MSstatsConvert HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 数据导入,质谱学,蛋白质组学,质量控制,软件
版本 1.12.1
在生物导体中 生物柴油3.12(R-4.0)(3.5年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=4.0)
进口 data.table、log4r、方法、checkmate、utils、stringi
系统要求
统一资源定位地址
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建议 tinytest、covr、knitr、rmarkdown
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导入我 MS统计,MSstatsBig公司,MSstatsLiP公司,MS统计PTM,MSstats闪亮,MSstatsTMT公司
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 MS统计转换_1.12.1.tar.gz
Windows二进制 MSstatsConvert_1.12.1.zip软件
macOS二进制(x86_64) MS统计转换_1.12.1.tgz
macOS二进制(arm64) MS统计转换_1.12.1.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MSstatsConvert
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MSstatsConvert
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/MSstatsConvert网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/MSstatsConvert网站/
软件包下载报告 下载统计信息
BioC 3.18的旧源代码包 源存档