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MS统计

无标签或基于标签的蛋白质组学实验中DDA、SRM和DIA的蛋白质显著性分析


生物导体版本:释放(3.18)

一套用于DDA、SRM和DIA实验中统计相对蛋白质显著性分析的工具。

作者:Meena Choi[aut,cre],Mateusz Staniak[aut],Tsung-Heng Tsai[aut],Ting Huang[aut',Olga Vitek[aut

维护人员:Meena Choi在gmail.com>

引文(从R中输入引文(“MSstats”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“MSstats”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“MSstats”)
MSstats:蛋白质/肽显著性分析 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式

细节

生物视图 免疫肿瘤学,质谱学,规范化,蛋白质组学,质量控制,软件,时间课程
版本 4.10.1
在生物导体中 生物技术2.13(R-3.0)(10.5年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=4.0)
进口 MS统计转换、data.table、checkmate、MASS、htmltools、,利马,lme4,预处理核心,生存,utils,Rcpp,ggplot2,ggresent,gplots,plotly,结婚,stats,grDevices,图形,方法,statmod
系统要求
统一资源定位地址 http://msstats.org
错误报告 https://groups.google.com/forum网站/#!论坛/msstats
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 MS统计4.10.1.tar.gz
Windows二进制 MSstats_4.10.1.zip软件
macOS二进制(x86_64) MS统计4.10.1.tgz
macOS二进制(arm64) MS统计4.10.1.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MSstats网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/MSstats
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/MSstats网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/MSstats网站/
软件包下载报告 下载统计信息
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