MS统计PTM
翻译后修饰的统计特征
生物导体版本:释放(3.18)
MSstatsPTM提供了定量描述翻译后修饰(PTM)的通用统计方法。支持DDA、DIA、SRM和串联质量标签(TMT)标签。通常,分析涉及PTM位点(即修饰残基)及其相应蛋白质的量化,以及量化结果的整合。MSstatsPTM提供了汇总、估算PTM站点丰度和检测PTM在实验条件下变化的功能。
作者:德文·科勒[aut,cre],Tsung-Heng Tsai[aut],Ting Huang[aut],Mateusz Staniak[aut',Meena Choi[aut]Olga Vitek[aut
维护人员:德文·科勒(Devon Kohler)<Kohler.d at东北部.edu>
引文(从R中输入引文(“MSstatsPTM”)
):
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“MSstatsPTM”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
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浏览幻影(“MSstatsPTM”)
细节
生物视图 |
差异表达式,免疫肿瘤学,质谱法,规范化,一个频道,蛋白质组学,质量控制,软件,双通道 |
版本 |
2.4.4 |
在生物导体中 |
生物柴油3.12(R-4.0)(3.5年) |
许可证 |
艺术-2.0 |
取决于 |
R(>=4.3) |
进口 |
dplyr、gridExtra、stringr、stats、ggplot2、stringi、grDevices、,MSstatsTMT公司,MS统计转换,MS统计,数据表,Rcpp,生物串,将死,ggrest |
系统要求 |
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统一资源定位地址 |
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错误报告 |
https://github.com/Vitek-Lab/MSstatsPTM/issues网站 |
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程序包档案
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