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生物学
第74卷| 第7部分
国际标准编号：2059-7983

2018年7月发布

突出显示的插图

封面插图：埃博拉病毒本迪布焦株核蛋白C末端结构域与泛特异性合成Fab复合物的结构(拉德万斯卡等。，第681页). 泛特异性Fab MJ20与埃博拉病毒本迪布焦株抗原的复合物的高分辨率晶体结构揭示了泛特异性的基础，并说明了噬菌体展示技术如何用于制造用于诊断或治疗应用的合适Fab。

研究论文

《水晶学报》。(2018).D类74,595-605
https://doi.org/10.107/S2059798318005752
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辛巴德：序列相关的分子置换管道

A.J.辛普金,F.辛科维奇,J.M.H.托马斯,M.Savko先生,A.列别捷夫,V.乌斯基,C.巴拉德,M.沃迪尔,吴瑞敏（R.Wu）,R.萨尼什维利,Y.Xu先生,M.-N.丽莎,A.布西亚佐,W.谢泼德,D.J.里格登和R.M.基根
辛巴德是一种序列相关的分子再安置管道，用于解决污染物结晶的分子再放置难题。它还可以用于查找结构相关的搜索模型，其中通过基于序列的搜索无法找到明显的同源物。
PDB参考:大肠杆菌DPS，6b0d;大肠杆菌过氧化氢酶HPII，6by0;变形沙雷菌氰化酶，6b6m
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《水晶学报》。(2018).D类74,606-620
https://doi.org/10.107/S2059798318005612
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MR-REX公司：基于低精度蛋白质模型的协同构象搜索和占有率优化的分子替换

J.J.维塔宁和Y.Zhang先生
一种新算法，MR-REX公司，已开发用于通过复制交换蒙特卡罗模拟执行分子置换搜索。该算法能够协同旋转和平移搜索以及同时进行冲突和占用优化，并提高了低精度结构模型上分子替换的成功率。
阅读文章
《水晶学报》。(2018).D类74,621至631
https://doi.org/10.107/S2059798318005764
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从深度TLS验证到基于元素运动构建的原子模型集合。二、。通过显式解释分析TLS细化结果

P.V.Afonine公司,P.D.亚当斯和A.乌尔朱姆采夫
对应于协调运动的各向异性原子位移参数（ADP）的值可以从精确的TLS矩阵中解析或数值获得。使用这两种方法获得的ADP之间的差异可用于评估TLS细化的结果。
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《水晶学报》。(2018).D类74,632-642
https://doi.org/10.107/S2059798318005648
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黄细胞色素的结构c（c）嗜盐碱性硫氧化细菌中与铜结合蛋白CopC相关的硫化物脱氢酶硫链弧菌paradoxusARh 1号机组

E.M.Osipov先生,A.V.莉莉娜,S.I.Tsallagov公司,T.N.萨伏诺娃,D.Y.索罗金,T.V.蒂霍诺娃和V.O.波波夫
单血色黄细胞色素的结构c（c）硫化脱氢酶与铜结合蛋白CopC共提纯并共结晶，溶解并精制至2.6 奥分辨率。
PDB参考:黄细胞色素之间的络合物c（c）硫化物脱氢酶和铜结合蛋白CopC帕拉多克斯锥虫，5n1吨
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《水晶学报》。(2018).D类74,643-654
https://doi.org/10.107/S2059798318006356
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剪接体DEAH-box-ATPase Prp2的晶体结构

A.施密特,F.哈曼,P.诺依曼和R.菲克纳
DEAH-box ATP酶Prp2在前mRNA剪接过程中起关键作用。在这里，该剪接体因子的前四个晶体结构被报道为两种不同的状态，其C末端结构域的灵活性和先前未描述的ADP构象也被报道。
PDB参考:DEAH盒解旋酶Prp2，6fa9;ADP配合物，晶型1，6fac;晶型2，6faa;晶型3，6fa5
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《水晶学报》。(2018).D类74,655-670
https://doi.org/10.107/S2059798318008136
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从晶体包装中鉴定G蛋白偶联受体二聚体

R.E.斯坦坎普
对G蛋白偶联受体晶体结构中分子间相互作用的分析表明，二聚体主要有两种类型。
阅读文章
《水晶学报》。(2018).D类74,671-680
https://doi.org/10.107/S205979831800774X
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参与植物繁殖的两种串联型果胶样受体激酶的晶体结构

S.穆苏,S.奥古斯丁,A.-O.罗马,C.布罗亚特和J.圣地亚哥
不同的长春花据报道，受体激酶1样膜受体是理解植物细胞壁传感和信号机制的第一步。
PDB参考:ANXUR1，6图;ANXUR2、6fih
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《水晶学报》。(2018).D类74,681-689
https://doi.org/10.107/S2059798318007878
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埃博拉病毒本迪布焦株核蛋白C末端结构域与泛特异性合成Fab复合物的结构

M.J.拉德万斯卡,雅斯科·奥斯基,E.达维多娃,U.德雷温达,T.三宅一生,D.A.恩格尔,A.A.Kossiakoff公司和Z.S.德雷温达
报道了使用噬菌体展示系统针对埃博拉病毒核蛋白C末端结构域选择的泛特异性合成Fab的高分辨率晶体结构。
PDB参考:埃博拉病毒（本迪布焦）核蛋白与Fab片段复合物的C末端结构域，5vkd
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《水晶学报》。(2018).D类74,690-694
https://doi.org/10.1107/S2059798318006691
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噬菌体展示筛选的底物与HIV-1蛋白酶的侧链氢键增强

I.W.温莎和雷恩斯（R.T.Raines）
报道了噬菌体展示选择的底物与HIV-1蛋白酶D25N变异体之间复合体的晶体结构，分辨率为1.1 Å. 这种结构具有一些前所未有的特点，特别是在酶和底物之间形成额外的氢键。
PDB参考:HIV-1蛋白酶（D25N，无活性）与噬菌体优化底物SGIFLETS，6bra复合物
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《水晶学报》。(2018).D类74,695-701
https://doi.org/10.107/S2059798318007271
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透明质酸受体稳定蛋白-2的FAS1结构域的晶体结构

A.双爪,B.拉布泽克,D.Krzemien公司,B.穆西拉克,P.格鲁德尼克,G.杜宾和T.A.霍拉克
本文介绍了稳定蛋白-2的第七个FAS1结构域的高分辨率X射线结构。该结构首次揭示了稳定蛋白-2的结构。
PDB参考:稳定蛋白-2，5n86的FAS1结构域
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《水晶学报》。(2018).D类74,702-710
https://doi.org/10.107/S2059798318006678
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引入锌结合的工程糖苷水解酶稳定性

T.L.埃林豪斯,J.H.佩雷拉,R.P.麦克安德鲁,D.H.韦尔纳,A.M.德乔瓦尼,J.M.Guenther先生,H.M.Tran先生,T.费尔德曼,B.A.西蒙斯,K.L.销售和P.D.亚当斯
将金属结合到纤维素酶中的工程可以提高其温度稳定性，同时保持其其他催化性能。
PDB参考:野生型J30，5u0h;J30 CCH，5u2o
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讣告

《水晶学报》。(2018).D类74,711-712
https://doi.org/10.1107/S2059798318006708
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布罗尔·埃里克·斯特兰德伯格（1930-2018）

K.K.坎南,A.利贾斯,L.利贾斯,S.Löfgren公司,M.G.Rossmann先生和T.Unge公司
Bror Strandberg是蛋白质和病毒结构测定的先驱之一。他是最早研究肌红蛋白高分辨率结构并继续研究病毒的科学家之一。
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