分子替换（MR）是蛋白质晶体X射线衍射中常用的相信息提取方法，但当搜索模型与目标不一致时，其成功率迅速下降。MR-REX公司已开发用于通过复制交换蒙特卡罗模拟执行MR搜索，从而实现协同旋转和平移搜索以及同步冲突和占用优化。MR-REX公司在一组1303个不同精度的蛋白质结构上进行了测试，并成功地将699个结构放置在相对标准偏差小于2的位置 Å到目标位置，比通过相位器然而，案例研究表明，许多模型相位器失败，并且MR-REX公司成功可以通过以下方式解决相位器通过修剪它们并使用非默认参数。研究了影响成功的因素以及导致成功的方法部分。结果表明，分子替换是一种新的途径，其性能优于最先进的MR方法（并且其结果与之互补），特别是对于远距离同源蛋白质。
