结晶信息框架

pdb2cif公司

描述

pdb2cif公司(伯恩斯坦等。,1998)是一个脚本,用于过滤PDB条目并生成mmCIF。

分销

如果您希望安装和使用此软件,请从上述网站下载最新版本。以下链接指向适合浏览或在网站不可用时使用的副本。然而,它们可能已经过时,并且缺少最新版本的完整功能。

状态

这是2004年10月6日的2.4.2版。

语言和平台

这些脚本是用perl、awk或periowk编写的,应该在任何支持perl或具有合适版本的awk的通用操作系统上运行。在某些系统上,可能需要使用目瞪口呆而不是awk公司.pdb2cif.awk使用了原始Aho、Kernighan和Weinberger中没有的功能Awk-一种模式扫描和处理语言,但后来在大多数系统上都添加了:函数和对“system”的调用。

文档

  • 安装:将选定的存档文件(pdb2cif.cshar.Z或pdb2civ.shar.Z,只需要一个)复制到空目录中。在此目录中,解压缩选定的存档文件,并根据需要使用C或Bourne shell执行它。
    cp pdb2cif.shar公司。Z/x/y/基础
    cd/x/y/基础
    解压缩pdb2cif.shar。Z轴
    sh pdb2cif.shar
    选择适合在所选解释器下运行的脚本并使其可执行。在大多数Unix系统上,这可以通过执行以下命令集之一来完成,具体取决于您是否希望perl、awk或oldewk版本为pdb2cif:
    chmod 755 pdb2cif.pl
    ln-s pdb2cif.pl pdb2cif

    chmod 755 pdb2cif.oawk公司
    ln-s pdb2cif.oawk pdb2cif

    chmod 755 pdb2cif.awk公司
    ln-s pdb2cif.awk pdb2cif
  • 一般信息: 自述文件(HTML格式)

使用条款和条件

软件版权归作者所有。
作者:P.E.伯恩、H.J.伯恩斯坦和F.C.伯恩斯坦

该软件在此处以开源许可证。有关本许可证未涵盖的任何用途的查询应直接发送至yaya@bernstein-plus-sons.com.

工具书类

H.J.伯恩斯坦。,伯恩斯坦,F.C.&伯恩,体育。(1998).CIF应用程序。八、。pdb2cif:将PDB条目转换为mmCIF格式。 J.应用。克里斯特。 31, 282-295.软件可从http://www.bernstein-plus-sons.com/software/pdb2cif.