结晶信息框架

Db装载机(mmCIF装载机)

描述

这个Db装载机应用程序(以前称为mmCIF装载机)是一种将CIF数据转换为可加载到各种关系数据库引擎(MySQL、Oracle、Sybase和DB2)中的形式的工具。该工具生成所有必要的SQL和辅助配置文件,以在关系数据库中创建和加载表。mmCIF数据文件和关系模式之间的信息映射由通用配置文件控制。对于任何特定的mmCIF数据表示,都可以支持许多关系模式。该工具还将生成与任何映射的关系模式等效的XML。

分发

如果您希望安装和使用此软件,请从上述网站下载最新版本。下面的链接指向适合浏览或在主网站不可用时使用的副本。然而,它们可能已经过时,并且缺少最新版本的完整功能。

状态

数据库 装载机分布于罗格斯大学结构生物信息学研究合作中心(RCSB),是蛋白质数据库中使用的软件系统的重要组成部分。意见应发送至jwest@rcsb.rutgers.edu.

语言和平台

该软件是用C++编写的,应该在带有合适C++编译器的Unix版本上运行。

文档

  • 安装:对于Unix类型安装,复制gzipped tar文件数据库-装载机-v4.017-prod-src.tar.gz进入空目录;使用Unix tar实用程序解压缩和解压缩文件。构建db-装载机使用make实用程序执行二进制操作:
    cp db-loader-v4.017-prod-src.tar。Z/g/h/i;cd/g/h/i
    gunzip db-loader-v4.017-prod-src.tar。Z;tar xvf db-loader-v4.017-prod-src.tar
    cd db-loader-v4.017-prod-src
    制作
    如果gzip公司焦油不可用,则可以将单个源文件保存到生成目录。
    有关更多详细信息,请参阅安装说明
  • 文档
  • 使用示例

使用条款和条件

软件版权所有©罗格斯-新泽西州立大学
作者:奥利维拉·托西奇和约翰·韦斯特布鲁克

该软件是根据蛋白质数据库/RCSB的许可在这里发布的。软件的使用受PDB软件许可证。有关任何其他用途的查询应发送至sw-help@rcsb.rutgers.edu.