雷尔
R中的RNA编辑工具
生物导体版本:释放(3.19)
用于识别和统计R中RNA编辑信号的工具包。支持从批量RNA和单细胞RNA-seq数据集识别位点,以及从比对文件中提取等位基因读取计数的通用方法。使用Bioconductor软件包和资源促进编辑信号的注释和探索性分析。
作者:肯特·里蒙迪[aut,cre],Kristen Wells-Wrasman[aut],瑞安·谢里丹,杰伊·海塞尔伯斯,RNA生物科学倡议
维护人员:肯特·里蒙迪
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“raer”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览Vignette(“raer”)
细节
生物视图 |
对齐,注释,新闻报道,表转录组学,特征提取,多重比较,RNA序列,排序,单个单元格,软件 |
版本 |
1.2.0 |
在生物导体中 |
生物柴油3.18(R-4.3)(1年) |
许可证 |
MIT+文件许可证 |
取决于 |
|
进口 |
统计、方法、,基因组范围,I范围,Rsamtools软件,牛基因组,生物串,总结性实验,单细胞实验,S4载体,基因组信息Db,基因组比对,基因组特征,生物遗传学,生物并行,rtracklayer公司,矩阵,气候变化指数 |
系统要求 |
GNU品牌 |
统一资源定位地址 |
https://rnabioco.github.io/raer https://github.com/rnabioco/raer |
错误报告 |
https://github.com/rnabioco/raer/issues |
查看更多
建议 |
测试那个(>= 3.0.0),针织物,设计2,边缘R,利马,rmarkdown公司,仿生风格,复杂热图,TxDb(发送日期)。哈皮恩斯。UCSC.hg38.known基因,SNPlocs公司。Hsapiens.dbSNP144.GRCh38型,英国基因组。哈皮恩斯。NCBI。GRCh38型,散射,尖叫声,舷窗,批注中心,冠状病毒,雷尔数据,txdb制造商 |
链接到 |
Rhtslib公司 |
增强功能 |
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取决于我 |
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导入我 |
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建议我 |
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链接到我 |
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生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。