雷尔

R中的RNA编辑工具


生物导体版本:释放(3.19)

用于识别和统计R中RNA编辑信号的工具包。支持从批量RNA和单细胞RNA-seq数据集识别位点,以及从比对文件中提取等位基因读取计数的通用方法。使用Bioconductor软件包和资源促进编辑信号的注释和探索性分析。

作者:肯特·里蒙迪[aut,cre],Kristen Wells-Wrasman[aut],瑞安·谢里丹,杰伊·海塞尔伯斯,RNA生物科学倡议

维护人员:肯特·里蒙迪

引文(从R中输入引文(“raer”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“raer”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览Vignette(“raer”)
介绍 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 对齐,注释,新闻报道,表转录组学,特征提取,多重比较,RNA序列,排序,单个单元格,软件
版本 1.2.0
在生物导体中 生物柴油3.18(R-4.3)(1年)
许可证 MIT+文件许可证
取决于
进口 统计、方法、,基因组范围,I范围,Rsamtools软件,牛基因组,生物串,总结性实验,单细胞实验,S4载体,基因组信息Db,基因组比对,基因组特征,生物遗传学,生物并行,rtracklayer公司,矩阵,气候变化指数
系统要求 GNU品牌
统一资源定位地址 https://rnabioco.github.io/raer https://github.com/rnabioco/raer
错误报告 https://github.com/rnabioco/raer/issues
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建议 测试那个(>= 3.0.0),针织物,设计2,边缘R,利马,rmarkdown公司,仿生风格,复杂热图,TxDb(发送日期)。哈皮恩斯。UCSC.hg38.known基因,SNPlocs公司。Hsapiens.dbSNP144.GRCh38型,英国基因组。哈皮恩斯。NCBI。GRCh38型,散射,尖叫声,舷窗,批注中心,冠状病毒,雷尔数据,txdb制造商
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增强功能
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 raer_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 raer_1.2.0.zip(仅64位)
macOS二进制(x86_64) raer_1.2.0.tgz
macOS二进制(arm64) raer_1.2.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/raer
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/r
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/raer/
包短Url https://bioconductor.org/packages/raer/
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