mzR公司

netCDF、mzXML、mzML和mzIdentML文件的解析器（质谱数据）

生物导体版本：释放（3.19）

mzR为质谱数据的通用文件格式和解析器提供了统一的API。它附带了mzXML、mzML和mzIdentML的蛋白质组向导库子集。netCDF读取代码以前曾在XCMS中使用过。

作者：Bernd Fischer、Steffen Neumann、Laurent Gatto、Qiang Kou、Johannes Rainer

维护人员：Steffen Neumann在ipb-halle.de>

引文（从R中输入引文（“mzR”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“mzR”）

对于旧版本的R，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“mzR”）

生物视图	数据导入,免疫肿瘤学,基础设施,质谱学,代谢组学,蛋白质组学,软件
版本	2.38.0
在生物导体中	生物碳2.9（R-2.14）（12.5年）
许可证	艺术-2.0
取决于	R（>=4.0.0），卢比（>=0.10.1），方法，实用程序
进口	博科生物,生物遗传学(>= 0.13.6),ProtGenerics公司(>= 1.17.3),ncdf4型
系统要求	C++11，GNU制造
统一资源定位地址	https://github.com/sneumann/mzR/
错误报告	https://github.com/sneumann/mzR/问题/

建议	msdata（msdata）(>= 0.15.1),RUnit（运行单位）,mz标识,仿生风格（>=22.5.19），针织物,XML格式,rmarkdown公司
链接到	卢比,Rhdf5库(>= 1.1.4)
增强功能
取决于我	M数据库
导入我	内收体R,俱乐部ID,DIALINR（直径）,MSnID,ms纯度,峰值脉冲,SIMAT公司,目标诱饵,自上而下,xcms公司,山药
建议我	批注中心,元注释,MsBackendRawFileReader,MsBackendSql,MsDataHub（消息数据中心）,理学硕士实验,Ms质量,PS匹配,qc度量,光谱,msdata（msdata）,蛋白质组学研究,色度转换器,埃拉
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生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	mzR_2.38.0.tar.gz
Windows二进制	mzR_2.38.0.zip码
macOS二进制（x86_64）	mzR_2.38.0.tgz
macOS二进制（arm64）	mzR_2.38.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mzR
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/mzR
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse-mzR/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/mzR/
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