M数据库
质谱和蛋白质组学的基本函数和类别
生物导体版本:发布(3.18)
MSnbase为质谱和蛋白质组学数据的操作、处理和可视化提供了基础设施,包括原始数据、定量数据和注释数据。
作者:Laurent Gatto、Johannes Rainer和Sebastian Gibb的贡献来自Guanghuang Yu、Samuel Wieczorek、Vasile-Cosmin Lazar、Vladislav Petyuk、Thomas Naake、Richie Cotton、Arne Smits、Martina Fisher、Ludger Goeminne、Adrian Sticker、Lieven Clement和Pascal Maas。
维护人员:劳伦特·加托在uclouvane.be>
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“MSnbase”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“MSnbase”)
细节
生物视图 |
数据导入,免疫肿瘤学,基础设施,质谱学,蛋白质组学,质量控制,软件 |
版本 |
2.28.1 |
在生物导体中 |
生物技术2.8(R-2.13)(13年) |
许可证 |
艺术-2.0 |
取决于 |
R(>=3.5),方法,生物遗传学(>= 0.7.1),博科生物(>= 2.15.2),毫兹罗(>= 2.29.3),S4矢量,ProtGenerics公司(>=1.29.1) |
进口 |
MsCoreUtils(MsCore实用程序),生物并行,I范围(>=2.13.28),年,vsn(vsn),网格,统计4,阿菲,插补,pca方法,麦地喹(>=1.16),mz标识(>=1.5.2)、摘要、晶格、ggplot2、XML、尺度、MASS、Rcpp |
系统要求 |
|
统一资源定位地址 |
https://lgatto.github.io/MSnbase网站 |
错误报告 |
https://github.com/lgatto/MSnbase/issues网站 |
查看更多
建议 |
testtat、pryr、gridExtra、microbenchmark、zoo、knitr(>=1.1.0),角色,雷迪索,pRoloc公司,pRolocdata公司(>= 1.7.1),msdata(msdata)(>=0.19.3),氧,rgl,rpx公司,批注中心,仿生风格(>=2.5.19),rmarkdown,imputeLCMD,normal,gplots,shinny,magrittr,总结性实验 |
链接到 |
卢比 |
增强功能 |
|
取决于我 |
带子,DAPAR数据,移动变压器,msmsEDA公司,msms测试,pRoloc公司,pRolocdata公司,pRolocGUI,qPLEX分析仪,蛋白质组学研究,突触,xcms公司 |
导入我 |
小集团MS,俱乐部ID,DAPAR公司,环境保护部,MSnID(MSnID),MS统计QC,峰值脉冲,优先购买权,ptairMS公司,qPLEX数据,R银行,自上而下的 |
建议我 |
批注中心,生物扫帚,生物遗传学,等压线,msdata(msdata),ms纯度,msqrob2型,项目开发署,qc度量,湿塑性塑料 |
指向我的链接 |
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生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
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