核倍体R

绘制可自定义的线性基因组，显示任意数据

生物导体版本：释放（3.19）

核型图R创建任意基因组的核型图，并提供一套完整的函数来绘制任意基因组上的任意数据。它模仿了许多基于R的图形功能，将它们与坐标更改功能相结合，自动将染色体和数据坐标映射到绘图坐标中。除了提供的数据绘图功能外，很容易添加新的功能。

作者：伯纳凝胶[aut，cre]

维护人员：Bernat Gel<igtp.cat的bgel>

引文（从R中输入引文（“染色体核型”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“染色体核型”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览Vignette（“核图R”）

生物视图	ChIPSeq公司,副本编号变化,新闻报道,DNASeq公司,数据导入,甲基Seq,一个频道,排序,软件,可视化
版本	1.30.0
在生物导体中	生物活性炭3.5（R-3.4）（7年）
许可证	艺术-2.0
取决于	R（>=3.4），区域R,基因组范围，方法
进口	区域R,基因组范围,I范围,Rsamtools软件、统计、图形、，备忘录,rtracklayer公司,基因组信息Db,S4载体,biovizBase公司,消化,贝塞尔,基因组特征,竹信号,注释Dbi，gr设备，变量注释
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/bernatgel/karyoploteR
错误报告	https://github.com/bernatgel/karyoploteR/issues

建议	生物风格,针织物,rmarkdown公司,降价,测试那个,马格里特,英国基因组。哈皮恩斯。加州大学圣保罗分校hg19,英国基因组。哈皮恩斯。UCSC.hg19.屏蔽,TxDb（发送日期）。哈皮恩斯。UCSC.hg19.known基因,TxDb（发送日期）。姆穆苏卢斯。UCSC.mm10已知基因,组织Hs.eg.db,组织管理例会.db,pasillaBamSubset系列
链接到
增强功能
取决于我	复制数字图
导入我	CNV过滤器,CNViz公司,多棱镜
建议我	类别,EpiMix公司,UPDhmm（更新）,MitoHEAR公司
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	核型R_1.30.0.tar.gz
Windows二进制	染色体核型R_1.30.0.zip
macOS二进制（x86_64）	染色体R_1.30.0.tgz
macOS二进制（arm64）	染色体R_1.30.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/karyoploteR
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/核型
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/karyoploteR/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/karyoploteR/
软件包下载报告	下载统计信息